2005
Indirect quantification of protein modification degree
HAVLIŠ, Jan, Ondrej ŠEDO a Zbyněk ZDRÁHALZákladní údaje
Originální název
Indirect quantification of protein modification degree
Název česky
Nepřímé stanovení rozsahu modifikace proteinu
Autoři
HAVLIŠ, Jan (203 Česká republika, garant), Ondrej ŠEDO (203 Česká republika) a Zbyněk ZDRÁHAL (203 Česká republika)
Vydání
Book of abstracts 2nd Czech Proteomic Conference, 2005
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Konferenční abstrakt
Obor
10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele
Česká republika
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Kód RIV
RIV/00216224:14310/05:00014091
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
Klíčová slova anglicky
protein modification degree; post-translation modification; mass spectrometry
Změněno: 9. 4. 2010 14:57, doc. Mgr. Jan Havliš, Dr.
V originále
In our work, we present a general, indirect method, using which it is possible to quantify the percentage of the given amino acid modified in total in a protein sequence (protein modification degree, PMD). From the knowledge of the identity of amino acid residues modifiable during post-translation process, PMD and its changes during time of particular amino acid residue can be determined. Such a quantification can be achieved by means of easy stable isotope modification (via 18O-labelling by trypsination) and consequential MALDI TOF MS analysis.
Česky
Tato práce prezentuje obecnou, nepřímou metodu, pomocí níž je možné stanovit rozsah celkové modifikace dané aminokyseliny proteinu (protein modification degree, PMD). Známe-li identitu aminokyseliny modifikovatelné posttranslační modifikací, PMD a její změny ve vztahu k těmto aminokyselin mohou být takto stanoveny. Toto stanovení je dosaženo snadným značením stabilními izotopy (značení 18O v průběhu stěpení trypsinem) a následnou MALDI TOF MS analýzou.
Návaznosti
| MSM0021622413, záměr |
| ||
| MSM0021622415, záměr |
|