Další formáty:
BibTeX
LaTeX
RIS
@inproceedings{587782, author = {Otyepka, Michal and Bártová, Iveta and Kříž, Zdeněk and Koča, Jaroslav}, address = {Bratislava}, booktitle = {ChemZi}, keywords = {Molecular dynamics; CDK2; CDK5; phosphorylation; regulation mechanism}, language = {cze}, location = {Bratislava}, isbn = {1336 - 7242}, pages = {277-277}, publisher = {Slovenská chemická spoločnosť}, title = {Dynamika regulačních enzymů buněčných procesů CDK2 a CDK5 studovaná molekulovou dynamikou}, year = {2005} }
TY - JOUR ID - 587782 AU - Otyepka, Michal - Bártová, Iveta - Kříž, Zdeněk - Koča, Jaroslav PY - 2005 TI - Dynamika regulačních enzymů buněčných procesů CDK2 a CDK5 studovaná molekulovou dynamikou PB - Slovenská chemická spoločnosť CY - Bratislava SN - 1336 7242 KW - Molecular dynamics KW - CDK2 KW - CDK5 KW - phosphorylation KW - regulation mechanism N2 - Cyklin-dependentní kinázy (CDK) jsou enzymy podílející se na regulaci řady významných buněčných procesů např. buněčného cyklu, apoptózy, diferenciace neuronálních buněk atp. CDK sestvají ze dvou podjednotek, katalytické podjednotky, kinázy a regulační podjednotky, cyklinu. Aktivita těchto enzymů je na molekulární úrovni zvýšena vazbou cyklinu a fosforylací aktivačních míst popř. defosforylací inhibičních míst. Jediný člen rodiny CDK a to CDK5 z tohoto schématu vybočuje, navzdory jeho vysoké homologii (60%) s CDK2 a dalšími enzymy z rodiny CDK. CDK5 není aktivována cyklinem ale regulačním enzymem p35 resp. p39 a navíc je tento komplex plně aktivní a nevyžaduje další aktivaci fosforylací, jako je tomu u ostatních CDK [1-3]. Navíc se ukazuje, že fosforylace v glycinové smyčce (G-smyčce), která je pro CDK2 inhibiční, je pro CDK5 stimulační [4]. Strukturní aspekty regulace fosforylací G-smyky byly nedávno odhaleny molekulovou dynamikou (MD) [5, 6]. O mechanismu aktivace fosforylací v G-smyčce CDK5 nedávno spekuloval v literatue Mapelli a kol. [3] a to zejména s ohledem na vazbu inhibitoru roskovitinu v aktivním místě enzymu. Příspěvek bude diskutovat rozdíly v interakčních energiích inhibitoru s CDK2 resp. CDK5 a dále rozdíly v interakcích mezi CDK a její regulační podjednotkou s cílem pochopit, rozdílný mechanismus regulace CDK5. ER -
OTYEPKA, Michal, Iveta BÁRTOVÁ, Zdeněk KŘÍŽ a Jaroslav KOČA. Dynamika regulačních enzymů buněčných procesů CDK2 a CDK5 studovaná molekulovou dynamikou. In \textit{ChemZi}. Bratislava: Slovenská chemická spoločnosť, 2005, s.~277-277. ISBN~1336~-~7242.
|