Other formats:
BibTeX
LaTeX
RIS
@inproceedings{587782,
author = {Otyepka, Michal and Bártová, Iveta and Kříž, Zdeněk and Koča, Jaroslav},
address = {Bratislava},
booktitle = {ChemZi},
keywords = {Molecular dynamics; CDK2; CDK5; phosphorylation; regulation mechanism},
language = {cze},
location = {Bratislava},
isbn = {1336 - 7242},
pages = {277-277},
publisher = {Slovenská chemická spoločnosť},
title = {Dynamika regulačních enzymů buněčných procesů CDK2 a CDK5 studovaná molekulovou dynamikou},
year = {2005}
}
TY - JOUR
ID - 587782
AU - Otyepka, Michal - Bártová, Iveta - Kříž, Zdeněk - Koča, Jaroslav
PY - 2005
TI - Dynamika regulačních enzymů buněčných procesů CDK2 a CDK5 studovaná molekulovou dynamikou
PB - Slovenská chemická spoločnosť
CY - Bratislava
SN - 1336 7242
KW - Molecular dynamics
KW - CDK2
KW - CDK5
KW - phosphorylation
KW - regulation mechanism
N2 - Cyklin-dependentní kinázy (CDK) jsou enzymy podílející se na regulaci řady významných buněčných procesů např. buněčného cyklu, apoptózy, diferenciace neuronálních buněk atp. CDK sestvají ze dvou podjednotek, katalytické podjednotky, kinázy a regulační podjednotky, cyklinu. Aktivita těchto enzymů je na molekulární úrovni zvýšena vazbou cyklinu a fosforylací aktivačních míst popř. defosforylací inhibičních míst. Jediný člen rodiny CDK a to CDK5 z tohoto schématu vybočuje, navzdory jeho vysoké homologii (60%) s CDK2 a dalšími enzymy z rodiny CDK. CDK5 není aktivována cyklinem ale regulačním enzymem p35 resp. p39 a navíc je tento komplex plně aktivní a nevyžaduje další aktivaci fosforylací, jako je tomu u ostatních CDK [1-3]. Navíc se ukazuje, že fosforylace v glycinové smyčce (G-smyčce), která je pro CDK2 inhibiční, je pro CDK5 stimulační [4]. Strukturní aspekty regulace fosforylací G-smyky byly nedávno odhaleny molekulovou dynamikou (MD) [5, 6]. O mechanismu aktivace fosforylací v G-smyčce CDK5 nedávno spekuloval v literatue Mapelli a kol. [3] a to zejména s ohledem na vazbu inhibitoru roskovitinu v aktivním místě enzymu. Příspěvek bude diskutovat rozdíly v interakčních energiích inhibitoru s CDK2 resp. CDK5 a dále rozdíly v interakcích mezi CDK a její regulační podjednotkou s cílem pochopit, rozdílný mechanismus regulace CDK5.
ER -
OTYEPKA, Michal, Iveta BÁRTOVÁ, Zdeněk KŘÍŽ and Jaroslav KOČA. Dynamika regulačních enzymů buněčných procesů CDK2 a CDK5 studovaná molekulovou dynamikou (Dynamics of human CDK2 and CDK5 studied by computer simulations). In \textit{ChemZi}. Bratislava: Slovenská chemická spoločnosť, 2005, p.~277-277. ISBN~1336~-~7242.
|
