2005
Charakterizace proteomu bakteriofága 812
ZDRÁHAL, Zbyněk, Luděk EYER, Hana KONEČNÁ a Jan PREISLERZákladní údaje
Originální název
Charakterizace proteomu bakteriofága 812
Název česky
Charakterizace proteomu bakteriofága 812
Název anglicky
Charakterization of bacteriphage 812 proteome
Autoři
ZDRÁHAL, Zbyněk (203 Česká republika), Luděk EYER (203 Česká republika), Hana KONEČNÁ (203 Česká republika) a Jan PREISLER (203 Česká republika, garant)
Vydání
Chemické listy, Praha, Asociace Českých chemických společností, 2005, 0009-2770
Další údaje
Jazyk
čeština
Typ výsledku
Článek v odborném periodiku
Obor
10406 Analytical chemistry
Stát vydavatele
Česká republika
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Odkazy
Impakt faktor
Impact factor: 0.445
Kód RIV
RIV/00216224:14310/05:00012894
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
UT WoS
000234182000014
Klíčová slova anglicky
bakteriophage; proteome; mass spectrometry; gel electrophoresis; anomal migration
Příznaky
Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 26. 6. 2009 10:40, prof. RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr.
V originále
Lytický bakteriofág 812 patří mezi slibné kandidáty na terapii stafylokokových infekcí jako náhrada léčby antibiotiky. Proteom bakteriofága 812 byl analyzován vybranými technikami hmotnostní spektrometrie a separace. Bylo identifikováno jedenáct proteinů z toho sedm poprvé. Gelová elektroforéza s peptidovým mapováním byla shledána nejúčinnější technikou pro celkovou analýzu; HPLC-ESI MS byla použita pro potvrzení ve sporných případech. Zdánlivě anomální migrace hlavního proteinu bičíkové pochvy (812_mtsp) byla vysvětlena po separaci gelovou elektroforézou za upravených podmínek a peptidovým mapováním pomocí MALDI TOF a TOF/TOF MS. Tři fragmenty proteinu 812_mtsp o podobné velikosti, které původně migrovaly v jedné zóně, byly odděleny a identifikovány. Charakterizace proteomu bakteriofága 812 je předpokladem pro budoucí srovnání standardního fága 812 s jeho mutanty a příbuznými fágy a korelaci změn proteomu se změnami rozmezí hostitele.
Anglicky
A lytic bacteriophage 812 ranks among to promising candidates for phage therapy, which emerges as an alternative to antibiotics for treatment of staphylococcal infections. Proteome of bacteriophage 812 was analyzed using various mass spectrometry techniques. Eleven proteins were identified, of which seven proteins were identified for the first time. Gel electrophoresis with peptide mass fingerprinting was found the most efficient for overall analysis; HPLC-ESI MS was used for confirmation in dubious cases. Seemingly abnormal migration of main tail sheath protein (812_mtsp) was explained after adjustment of gel electrophoresis conditions and peptide mass fingerprinting combined with MALDI TOF/TOF MS results. Three similarly-sized 812_mtsp fragments, which originally migrated in one band, were separated and identified. Proteome characterization of bacteriophage 812 is a prerequisite for future comparison of the standard-type phage 812 with its mutants and related phages to correlate proteome changes with their different host range.
Návaznosti
| GA203/03/0515, projekt VaV |
| ||
| MSM0021622415, záměr |
|