ŠERÝ, Omar, Sixtus HYNIE, Hana KONEČNÁ, Renáta PITELOVÁ, Pavel ŠÍDA a Věra KLENEROVÁ. VYUŽITÍ REALTIME SYSTÉMU PRO KVANTIFIKACI RNA A JEHO POUŽITÍ V MOLEKULÁRNÍ PSYCHIATRII. Psychiatrie. Praha: Tigis, 2006, roč. 10, Suppl. 1, s. 70. ISSN 1212-6845.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název VYUŽITÍ REALTIME SYSTÉMU PRO KVANTIFIKACI RNA A JEHO POUŽITÍ V MOLEKULÁRNÍ PSYCHIATRII
Název česky VYUŽITÍ REALTIME SYSTÉMU PRO KVANTIFIKACI RNA A JEHO POUŽITÍ V MOLEKULÁRNÍ PSYCHIATRII
Název anglicky The usage of RealTime system in RNA quatification in molecular psychiatry
Autoři ŠERÝ, Omar (203 Česká republika, garant), Sixtus HYNIE (203 Česká republika), Hana KONEČNÁ (203 Česká republika), Renáta PITELOVÁ (203 Česká republika), Pavel ŠÍDA (203 Česká republika) a Věra KLENEROVÁ (203 Česká republika).
Vydání Psychiatrie, Praha, Tigis, 2006, 1212-6845.
Další údaje
Originální jazyk čeština
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 30000 3. Medical and Health Sciences
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Kód RIV RIV/00216224:14310/06:00016606
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
Klíčová slova anglicky RealTime PCR molecular psychiatry quantification
Změnil Změnil: prof. RNDr. Omar Šerý, Ph.D., učo 18120. Změněno: 1. 3. 2007 17:10.
Anotace
Z dostupných metod molekulární biologie jsme pro studie mechanismů účinku stresu na transkripci vybraných genů zvolili metodu RealTime PCR, která umožňuje kvantifikaci mRNA. Zkoumané geny byly vybírány na základě znalosti molekulární podstaty regulací neurálních systémů, které se mění v důsledku působení stresu, a které se podílejí na kognitivních funkcích a chování. Pro naše studie jsme připravili metodiky RealTime PCR kvantifikace mRNA genů pro oxytocin, CRH (corticotropin-releasing factor), CREB (cAMP response element-binding protein) a GADPH (housekeeping gene - glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenace). Tzv. TaqMan sondy specifické pro tyto mRNA byly designovány v programu PrimerExpress ze sekvencí volně dostupných v databázi GeneBank. Kritickým bodem v laboratorním postupu se ukázala izolace mRNA. Z několika možných postupů jsme vybrali izolaci čisté mRNA pomocí paramagnetických částic s vázaným polyT (kit chemagic Direct mRNA, chemagen). Jako standard (housekeeping gene), ke kterému jsme vztahovali výsledky amplifikace mRNA pro oxytocin, CRH a CREB jsme zvolili GADPH, u něhož je koncentrace mRNA v nervových buňkách uváděna jako nezávislá a konstantní. První výsledky ukázaly, že se podařilo zavézt vhodný systém kvantifikace vzhledem k tomu, že účinnost řetězové polymerázové reakce se jeví jako konstantní mezi metodikami pro jednotlivé geny, což je základním předpokladem pro možnost výpočtu relativní kvantity mRNA zkoumaných genů. Nově zavedené metodiky položily základ pro jejich použití při studiích vlivu různých faktorů na genovou transkripci. Metoda kvantifikace mRNA pomocí RealTime PCR obecně najde své použití v řadě oblastí a rozšíří výsledky a závěry studií, které byly již dříve získány jinými metodami, např. microarrays.
Anotace anglicky
We used RealTime PCR system with TaqMan probes for the detection and the quantification of mRNA of CRH, CREB and GADPH genes.
Návaznosti
MSM0021620806, záměrNázev: Molekulární biologie a patologie buňky za normy a u vybraných klinicky závažných patologických procesů
VytisknoutZobrazeno: 19. 7. 2024 12:31