Identifikace regulátorů genové exprese u Treponema pallidum.

ČEJKOVÁ, Darina a David ŠMAJS. Identifikace regulátorů genové exprese u Treponema pallidum. In Sborník příspěvků IX. Pracovního setkání biochemiků a molekulárních biologů. Brno: Přírodovědecká fakulta MU, 2005, s. 5. ISBN 80-210-3635-4.

Základní údaje

Originální název

Identifikace regulátorů genové exprese u Treponema pallidum.

Název anglicky

Identification of gene expression regulators in Treponema pallidum.

Autoři

ČEJKOVÁ, Darina a David ŠMAJS

Vydání

Brno, Sborník příspěvků IX. Pracovního setkání biochemiků a molekulárních biologů, s. 5-5, 2005

Nakladatel

Přírodovědecká fakulta MU

---

Další údaje

Jazyk

čeština

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

ISBN

80-210-3635-4

Klíčová slova anglicky

Treponema pallidum ssp. pallidum; regulation of gene expression

Štítky

regulation of gene expression, Treponema pallidum ssp. pallidum

---

Anotace

V originále

Metodou real-time RT PCR jsme vyšetřili regulační funkci treponemálních genů rpoN (kódujícího sigma-54 faktor) a fhlA (kódujícího domnělý transkripční faktor). Tyto geny byly naklonovány do expresních plazmidů pBAD/HisB kompatibilních s replikačním systémem BAC. Exprese klonovaných genů byla regulována koncentrací arabinózy v kultivačním mediu. Vzniklé konstrukty obsahovaly izolovaně naklonované geny i plazmidy obsahující oba geny současně. Vyšetřili jsme růstovou křivku kmene DH10B s rekombinantními plazmidy za aerobních a semianaerobních podmínek Za neindukovaných aerobních podmínek roste kmen nesoucí konstrukt s oběma geny rpoN a fhlA výrazně pomaleji než ostatní vzorky. Po indukci arabinózou pozorujeme pomalejší růst u všech kmenů E. coli nesoucí geny rpoN a fhlA a také u kmene nesoucího konstrukt s oběma geny rpoN a fhlA. Protože T. pallidum nelze kultivovat v podmínkách in vitro, expresi treponemálních genů jsme monitorovali v 19 klonech BAC knihovny T. pallidum v E. coli DH10B. Konstrukty s geny rpoN a fhlA byly transformovány do E. coli DH10B s kosmidy DSTP147 a DSTP085. Z těchto kmenů byla izolována RNA 60 a 120 minut po indukci arabinózou a hladina transkriptů vyšetřena kvantitativní RT PCR. Nejvíce jsou regulovány geny TP 9 (tprA), TP 28 (předpovězený gen pro hemolysin), TP 30 (groEL), TP 1037 (hlyIII) a TP 1038 (TpF1). Regulační proteiny RpoN a FhlA přitom spolupracují na pozitivní regulaci transkripce těchto genů.

Anglicky

The possible regulatory functions of two treponemal genes, rpoN (encoding sigma-54 factor) and fhlA (encoding putative transcriptional regulator) were tested using real-time RT PCR. Genes TP0009 (tprA), TP0028 (putative hemolysin gene), TP0030 (groEL), TP1037 (hlyIII) and TP1038 (TpF1)were found to be regulated by RpoN a FhlA proteins.

---

Návaznosti

GA310/04/0021, projekt VaV	Název: Postgenomické studie syfilitické spirochety Treponema pallidum Investor: Grantová agentura ČR, Postgenomické studie syfilitické spirochety Treponema pallidum
MSM0021622415, záměr	Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
NI7351, projekt VaV	Název: Komparativní genomika patogenních spirochet rodu Treponema: cesta k sekvenčně specifické diagnostice Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Komparativní genomika patogenních spirochet rodu Treponema: cesta k sekvenčně specifické diagnostice