2005
Molekulární interakce kolicinu se svým imunitním proteinem.
JANALÍKOVÁ, Magda a David ŠMAJSZákladní údaje
Originální název
Molekulární interakce kolicinu se svým imunitním proteinem.
Název anglicky
Molecular interaction of colicin U with immunity protein
Autoři
JANALÍKOVÁ, Magda (203 Česká republika) a David ŠMAJS (203 Česká republika, garant)
Vydání
Abstrakta 49. Studentské vědecké konference, 2005
Další údaje
Jazyk
čeština
Typ výsledku
Konferenční abstrakt
Obor
Genetika a molekulární biologie
Stát vydavatele
Česká republika
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Kód RIV
RIV/00216224:14110/05:00013192
Organizační jednotka
Lékařská fakulta
Klíčová slova anglicky
colicin U; colicin Y; immunity protein
Štítky
Změněno: 8. 4. 2010 16:28, prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D.
V originále
Cíl: Identifikovat aminokyselinové zbytky C-koncové domény kolicinu U zprostředkující vazbu se svým imunitním proteinem. Bylo zkonstruováno více než 40 mutantních kolicinových genů U/Y a účinek jimi syntetizovaných proteinů byl testován na imunitní proteiny kolicinu U a Y. Koliciny s většinou bodových mutací byly rozpoznávány imunitními proteiny stejně jako původní koliciny. Koliciny s bodovými mutacemi G580V a F576Y byly rozpoznávány signifikantně méně a prokázaly jednoznačný význam aminokyselinových zbytků G580 a F576 pro interakci kolicinu U s imunitním proteinem kolicinu U. Další slabé interakční místo, aminokyselinový zbytek N605, leží distálně od předchozích dvou. U kolicinu Y byla identifikována aminokyselina Y586 a slabší interakční místa A589 a A577-I578, jež se účastní vazby s imunitním proteinem kolicinu Y.
Anglicky
Colicin U is an antibacterial pore-forming toxin produced by Shigella boydii that kills sensitive bacterial strains of Escherichia coli and closely related organisms The colicin-immunity protein recognition is a suitable model for studying protein-protein interactions. More than 40 mutant colicins were prepared and their toxic effect was tested on the sensitive bacteria transformed with plasmid harboring either cui (colicin U immunity) gene or cyi (colicin Y immunity) gene. Colicin U variants with point mutations in the hydrophobic hairpin, F576Y and G580V, were significantly less recognized by Cui, in addition to colicin U with K609R mutation localized downstream of hydrophobic hairpin. In the colicin Y pore-forming domain, Y586 and A589 were identified as interaction sites with Cyi in the hydrophobic hairpin, in addition to A577-I578 in the helix 8 of colicin Y pore forming domain.
Návaznosti
| GA310/03/1091, projekt VaV |
|