a 2005

Komparativní genomika Treponema pallidum technikou genomové hybridizace na oligonukleotidovém čipu.

MATĚJKOVÁ, Petra a David ŠMAJS

Základní údaje

Originální název

Komparativní genomika Treponema pallidum technikou genomové hybridizace na oligonukleotidovém čipu.

Název anglicky

Comparative genomics of T. pallidum strains Nichols and SS14 on the oligonucleotide array

Autoři

MATĚJKOVÁ, Petra (203 Česká republika) a David ŠMAJS (203 Česká republika, garant)

Vydání

Abstrakta 49. Studentské vědecké konference, 2005

Další údaje

Jazyk

čeština

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Kód RIV

RIV/00216224:14110/05:00013195

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

Klíčová slova anglicky

Treponema pallidum ssp. pallidum; Nichols; SS14

Štítky

Změněno: 8. 4. 2010 16:16, prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D.

Anotace

ORIG EN

V originále

Cíl: Cílem práce bylo sekvenovat genom Treponema pallidum subsp. pallidum SS14 a porovnat získanou kompletní genomovou sekvenci se sekvencí T. pallidum subsp. pallidum Nichols. Oba porovnávané kmeny způsobují pohlavně přenosné onemocnění syfilis. Celkem bylo v genomu kmene SS14 nalezeno 329 SNP, 7 delecí a 4 inzerce.

Anglicky

The genome of Treponema pallidum ssp. pallidum strain SS14, the causative agent of syphilis, was sequenced using oligonucleotide arrays. The sequences of more than 49 kb of the SS14 genome were verified by capillary sequencing approach. When compared to T. pallidum ssp. pallidum strain Nichols, the genome of SS14 contained 329 single nucleotide changes (219 transitions and 104 transversions), 7 deletions and 4 insertions.

Návaznosti

GA310/04/0021, projekt VaV
Název: Postgenomické studie syfilitické spirochety Treponema pallidum
Investor: Grantová agentura ČR, Postgenomické studie syfilitické spirochety Treponema pallidum
MSM0021622415, záměr
Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
NI7351, projekt VaV
Název: Komparativní genomika patogenních spirochet rodu Treponema: cesta k sekvenčně specifické diagnostice
Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Komparativní genomika patogenních spirochet rodu Treponema: cesta k sekvenčně specifické diagnostice