a 2005

Studium domnělých regulátorů genové exprese a sigma 54-závislých promotorů spirochety Treponema pallidum.

ČEJKOVÁ, Darina a David ŠMAJS

Základní údaje

Originální název

Studium domnělých regulátorů genové exprese a sigma 54-závislých promotorů spirochety Treponema pallidum.

Název anglicky

PUTATIVE GENE EXPRESSION REGULATORS AND 54-DEPENDENT PROMOTERS OF THE SPIROCHETE TREPONEMA PALLIDUM

Autoři

ČEJKOVÁ, Darina (203 Česká republika) a David ŠMAJS (203 Česká republika, garant)

Vydání

Sborník abstraktů XIV. Tomáškových dnů 2005, 2005

Další údaje

Jazyk

čeština

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Kód RIV

RIV/00216224:14110/05:00013196

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

Klíčová slova anglicky

Treponema pallidum subsp. pallidum; gene expression profiling; BAC clones

Štítky

Změněno: 8. 4. 2010 17:30, prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D.

Anotace

ORIG EN

V originále

Spirocheta T pallidum ssp. pallidum, původce syfilis, je obligátní lidský patogen. Tuto treponemu nelze kultivovat v podmínkách in vitro. Sekvenace genomu a následná konstrukce BAC knihovny v E. coli otevřely nové možnosti výzkumu T. pallidum (např. studium regulace transkripce). Studium regulátorů jsme prováděli v klonech BAC knihovny T. pallidum v E. coli DH10B. Geny rpoN (kódující 54 faktor) a fhlA (kódující aktivátor transkripce) byly naklonovány do expresních, arabinózou indukovatelných, plazmidů pBAD/HisB, které jsou kompatibilní s replikačním systémem kosmidu BAC. Vyšetřili jsme růstovou křivku kmene DH10B s rekombinantními plazmidy. Metodou Q-PCR jsme vyšetřili expresi vybraných treponemálních genů po indukci exprese genů rpoN a fhlA. 54 závislé promotory jsme identifikovali analýzou in silico a předpovězené transkripty následně mapovali pomocí PCR z cDNA. Proteiny RpoN a FhlA jsou tedy pozitivní regulátory genové exprese a ovlivňují transkripci několika treponemálních genů.

Anglicky

Spirochete T. pallidum ssp. pallidum, the causative agent of syphilis, is an obligate human pathogen that cannot be cultured continuously under in vitro conditions. Genome sequencing and constructions of BAC library of treponemal DNA in E. coli open new areas for the next studies (e.g. for the study on gene expression regulation). Genes rpoN (coding for 54 factor) and fhlA (coding for putative transcriptional activator) were cloned into the arabinose-inducible expression vector pBAD/HisB. Q-PCR technique was used for the study of putative gene regulation mediated by RpoN and FhlA in the clones of the BAC library. 54-dependent promoters were identified in the T. pallidum genome using in silico approach and the predicted transcripts were mapped by PCR technique. Proteins RpoN and FhlA are positive regulators of gene expression of several treponemal genes.

Návaznosti

GA310/04/0021, projekt VaV
Název: Postgenomické studie syfilitické spirochety Treponema pallidum
Investor: Grantová agentura ČR, Postgenomické studie syfilitické spirochety Treponema pallidum
MSM0021622415, záměr
Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
NI7351, projekt VaV
Název: Komparativní genomika patogenních spirochet rodu Treponema: cesta k sekvenčně specifické diagnostice
Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Komparativní genomika patogenních spirochet rodu Treponema: cesta k sekvenčně specifické diagnostice