Studium domnělých regulátorů genové exprese a sigma 54-závislých promotorů spirochety Treponema ...
ČEJKOVÁ, Darina a David ŠMAJS. Studium domnělých regulátorů genové exprese a sigma 54-závislých promotorů spirochety Treponema pallidum. In Sborník abstraktů XIV. Tomáškových dnů 2005. 2005. |
Další formáty:
BibTeX
LaTeX
RIS
|
Základní údaje | |
---|---|
Originální název | Studium domnělých regulátorů genové exprese a sigma 54-závislých promotorů spirochety Treponema pallidum. |
Název anglicky | PUTATIVE GENE EXPRESSION REGULATORS AND 54-DEPENDENT PROMOTERS OF THE SPIROCHETE TREPONEMA PALLIDUM |
Autoři | ČEJKOVÁ, Darina (203 Česká republika) a David ŠMAJS (203 Česká republika, garant). |
Vydání | Sborník abstraktů XIV. Tomáškových dnů 2005, 2005. |
Další údaje | |
---|---|
Originální jazyk | čeština |
Typ výsledku | Konferenční abstrakt |
Obor | Genetika a molekulární biologie |
Stát vydavatele | Česká republika |
Utajení | není předmětem státního či obchodního tajemství |
Kód RIV | RIV/00216224:14110/05:00013196 |
Organizační jednotka | Lékařská fakulta |
Klíčová slova anglicky | Treponema pallidum subsp. pallidum; gene expression profiling; BAC clones |
Štítky | BAC clones, gene expression profiling, Treponema pallidum subsp. pallidum |
Změnil | Změnil: prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D., učo 1116. Změněno: 8. 4. 2010 17:30. |
Anotace |
---|
Spirocheta T pallidum ssp. pallidum, původce syfilis, je obligátní lidský patogen. Tuto treponemu nelze kultivovat v podmínkách in vitro. Sekvenace genomu a následná konstrukce BAC knihovny v E. coli otevřely nové možnosti výzkumu T. pallidum (např. studium regulace transkripce). Studium regulátorů jsme prováděli v klonech BAC knihovny T. pallidum v E. coli DH10B. Geny rpoN (kódující 54 faktor) a fhlA (kódující aktivátor transkripce) byly naklonovány do expresních, arabinózou indukovatelných, plazmidů pBAD/HisB, které jsou kompatibilní s replikačním systémem kosmidu BAC. Vyšetřili jsme růstovou křivku kmene DH10B s rekombinantními plazmidy. Metodou Q-PCR jsme vyšetřili expresi vybraných treponemálních genů po indukci exprese genů rpoN a fhlA. 54 závislé promotory jsme identifikovali analýzou in silico a předpovězené transkripty následně mapovali pomocí PCR z cDNA. Proteiny RpoN a FhlA jsou tedy pozitivní regulátory genové exprese a ovlivňují transkripci několika treponemálních genů. |
Anotace anglicky |
---|
Spirochete T. pallidum ssp. pallidum, the causative agent of syphilis, is an obligate human pathogen that cannot be cultured continuously under in vitro conditions. Genome sequencing and constructions of BAC library of treponemal DNA in E. coli open new areas for the next studies (e.g. for the study on gene expression regulation). Genes rpoN (coding for 54 factor) and fhlA (coding for putative transcriptional activator) were cloned into the arabinose-inducible expression vector pBAD/HisB. Q-PCR technique was used for the study of putative gene regulation mediated by RpoN and FhlA in the clones of the BAC library. 54-dependent promoters were identified in the T. pallidum genome using in silico approach and the predicted transcripts were mapped by PCR technique. Proteins RpoN and FhlA are positive regulators of gene expression of several treponemal genes. |
Návaznosti | |
---|---|
GA310/04/0021, projekt VaV | Název: Postgenomické studie syfilitické spirochety Treponema pallidum |
Investor: Grantová agentura ČR, Postgenomické studie syfilitické spirochety Treponema pallidum | |
MSM0021622415, záměr | Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací |
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací | |
NI7351, projekt VaV | Název: Komparativní genomika patogenních spirochet rodu Treponema: cesta k sekvenčně specifické diagnostice |
Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Komparativní genomika patogenních spirochet rodu Treponema: cesta k sekvenčně specifické diagnostice |
VytisknoutZobrazeno: 19. 8. 2024 12:33