Molekulární rozpoznávání kolicinů U a Y svými imunitními proteiny.

JANALÍKOVÁ, Magda and David ŠMAJS. Molekulární rozpoznávání kolicinů U a Y svými imunitními proteiny. (Molecular recognition of colicin U and Y by their immunity proteins). In Sborník abstraktů XIV. Tomáškových dnů 2005. 2005.

Basic information

• Original name: Molekulární rozpoznávání kolicinů U a Y svými imunitními proteiny.
• Name (in English): Molecular recognition of colicin U and Y by their immunity proteins
• Authors: JANALÍKOVÁ, Magda (203 Czech Republic) and David ŠMAJS (203 Czech Republic, guarantor).
• Edition: Sborník abstraktů XIV. Tomáškových dnů 2005, 2005.

Other information

• Original language: Czech
• Type of outcome: Conference abstract
• Field of Study: Genetics and molecular biology
• Country of publisher: Czech Republic
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• RIV identification code: RIV/00216224:14110/05:00013197
• Organization unit: Faculty of Medicine
• Keywords in English: colicin U; colicin Y; immunity protein
• Tags: colicin U, colicin Y, immunity protein

Abstract

Koliciny jsou antibakteriální proteiny, jejichž geny jsou lokalizovány na plazmidech a jsou produkovány bakteriálními kmeny z čeledi Enterobacteriaceae (zejména druhem Escherichia coli). Toxický účinek (tvorba iontových kanálů v plazmatické membráně) je zajišťován C-koncovou doménou a je omezen na citlivé kmeny druhů stejných nebo příbuzných kmenu produkčnímu. Syntézou imunitního proteinu, jehož gen je součástí kolicinogenního plazmidu, se producenti brání letálnímu efektu syntetizovaného kolicinu. Interakce mezi rozpustným kolicinem a membránově vázaným imunitním proteinem je vhodným modelem pro studium protein-proteinových interakcí. Vybrali jsme si dvojici kolicinů U a Y, mezi nimiž je 87% totožnost na úrovni aminokyselinové sekvence a přesto jejich producenti nejsou navzájem zkříženě imunní. Mutovali jsme aminokyseliny kolicinu U (Y) ve smyslu sekvence kolicinu Y (U), sledovali změny v interakci mutovaných kolicinů s imunitním proteinem a určili interakční aminokyseliny kolicinu U a Y.

Abstract (in English)

Colicins are antibacterial toxins produced by strains of Escherichia coli and related bacteria that provide a selective advantage against closely related strains in the competition among bacteria. Toxic effect that is mediated by the C-terminal domain is depolarization of the cytoplasmic membrane of sensitive cells. The plasmid encoded immunity protein ensures that producers are protected against the effect of their own colicin. The recognition of soluble colicin by the membrane-bounded immunity protein is a suitable model for studying protein-protein interactions. The pair of colicins U and Y had 87% identity in their pore-forming domains but the corresponding producers were not cross-immune. The amino acids of colicin U (Y) were mutated into those appearing in the sequence of colicin Y (U) and changes in the interactions between mutated colicins and immunity proteins were monitored and interactions sites were identified.

Links

• GA310/03/1091, research and development project: Name: Mapování interakce kolicinů s citlivou a imunní bakteriální buňkou: receptorové studie a inaktivace kolicinu jeho imunitním proteinem

Investor: Czech Science Foundation

• MSM0021622415, plan (intention): Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations