Comparing genomes of pathogenic and non-pathogenic spirochetes: DNA-microarray hybridizations, whole genome fingerprinting and DNA sequencing.

ŠMAJS, David, Petra MATĚJKOVÁ, Michal STROUHAL, S.J. NORRIS a G.M. WEINSTOCK. Comparing genomes of pathogenic and non-pathogenic spirochetes: DNA-microarray hybridizations, whole genome fingerprinting and DNA sequencing. In Abstract Book of NATO Advanced Research Workshop on Molecular Biology of Spirochetes. 2005.

Základní údaje

Originální název

Comparing genomes of pathogenic and non-pathogenic spirochetes: DNA-microarray hybridizations, whole genome fingerprinting and DNA sequencing.

Název česky

Srovnání genomů patogenních a nepatogenních spirochet pomocí DNA-microarray hybridizace, whole genome fingerprintingu a DNA sekvenování.

Autoři

ŠMAJS, David (203 Česká republika, garant), Petra MATĚJKOVÁ (203 Česká republika), Michal STROUHAL (203 Česká republika), S.J. NORRIS (840 Spojené státy) a G.M. WEINSTOCK (840 Spojené státy)

Vydání

Abstract Book of NATO Advanced Research Workshop on Molecular Biology of Spirochetes, 2005

---

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Kód RIV

RIV/00216224:14110/05:00013211

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

Klíčová slova anglicky

Treponema pallidum ssp. pallidum; Treponema pallidum ssp. pertenue; Treponema paraluiscuniculi

Štítky

Treponema pallidum ssp. pallidum, Treponema pallidum ssp. pertenue, Treponema paraluiscuniculi

---

Anotace

V originále

Genomes of closely related treponemes, Treponema pallidum ssp. pallidum (strains Nichols and SS14) and Treponema pallidum ssp. pertenue (Samoan D) were compared with the genome of Treponema paraluiscuniculi (strain Cuniculi A) using comparative genomic techniques. T. pallidum ssp. pallidum is the causative agent of highly invasive human disease syphilis, T. pallidum ssp. pertenue is the causative agent of yaws and T. paraluiscuniculi is not pathogenic to humans. When compared to Nichols genome, 1, 8 and 34 differences in the BamH I target restriction sites and 3, 7 and 20 indels were found in the genome of SS14, Samoan D and T. paraluiscuniculi, respectively.

Česky

Genomy blízce příbuzných treponem, Treponema pallidum ssp. pallidum (kmenů Nichols a SS14) a Treponema pallidum ssp. pertenue (Samoan D) byly porovnány s genomem Treponema paraluiscuniculi (kmenCuniculi A) s použitím technik komparativní genomiky. Ve srovnání s kmenem Nichols jsme nalezli, 1, 8 a 34 změn pro cílovou sekvenci restriktázy BamH I a 3, 7 a 20 inzercí a delecí v genomech SS14, Samoan D a T. paraluiscuniculi.

---

Návaznosti

GA310/04/0021, projekt VaV	Název: Postgenomické studie syfilitické spirochety Treponema pallidum Investor: Grantová agentura ČR, Postgenomické studie syfilitické spirochety Treponema pallidum
MSM0021622415, záměr	Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
NI7351, projekt VaV	Název: Komparativní genomika patogenních spirochet rodu Treponema: cesta k sekvenčně specifické diagnostice Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Komparativní genomika patogenních spirochet rodu Treponema: cesta k sekvenčně specifické diagnostice