D 2005

Enhancement of Images Acquired using Optical Microscope

HUBENÝ, Jan

Základní údaje

Originální název

Enhancement of Images Acquired using Optical Microscope

Název česky

Vylepšení obrázků pořízených optickým mikroskopem

Autoři

HUBENÝ, Jan (203 Česká republika, garant)

Vydání

Brno (Česká republika), Proceedings of the 1st International Summer School on Computational Biology, s. 29-38, 2005

Nakladatel

Masarykova universita

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

10201 Computer sciences, information science, bioinformatics

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Kód RIV

RIV/00216224:14330/05:00014836

Organizační jednotka

Fakulta informatiky

ISBN

80-210-3907-8

Klíčová slova anglicky

nonlinear diffusion; biomedical application; AOS numerical scheme; confocal microscopy
Změněno: 22. 2. 2006 14:11, RNDr. Jan Hubený

Anotace

V originále

Due to the limitations of the scanning process, the image data acquired using confocal microscope are of-ten corrupted by the noise. Therefore some image preprocessing, which would reduce the noise without degradation of the underlying image, is needed before any further stage of image analysis. In this review we will discuss several well-known nonlinear diffusion filters, as they were published in the last decade. These filters are based on evolution of nonlinear partial differential equations. Unlike the common linear filters, they significantly reduce the amount of noise in the image while preserving details or even enhancing some edges. We will present efficient numerical schemes for solving such equations. Last but not least practical examples, comparison of the behaviour of individual methods and our experience with these filters will be shown.

Česky

Obrazová data pořízená konfokálním mikroskopem jsou často zatížena šumem. Proto je nutné obrázek upravit před dalším zpracováním. Je žádoucí odstranit šum za současného zachování hran a významné informace. V tom to čl8nku budeme diskutovat několik dobře známých nelineárních difúzních filtrů tak jak byly publikovány v posledních deseti letech. V pozadí těchto filtrů je řešení parciálních diferenciálních rovnic. Narozdíl od běžně užívaných filtrů nelineární difúzní filtry významě potlačují šum a zároveň zachovávají hrany a významnou obrazovou informaci. Dále ukážeme efektivní numerická schémata k výpočetní realizaci těchto filtrů. Nakonec ukážeme a okomentujeme praktické příklady a naše zkušenosti s používáním těchto fitrů.

Návaznosti

MSM0021622419, záměr
Název: Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy