2006
Improved 3D Reconstruction of Interphase Chromosomes Based on Nonlinear Diffusion Filtering
HUBENÝ, Jan, Pavel MATULA, Petr MATULA a Michal KOZUBEKZákladní údaje
Originální název
Improved 3D Reconstruction of Interphase Chromosomes Based on Nonlinear Diffusion Filtering
Název česky
Vylepšení 3D rekonstrukce chromosomů v interfázi založené na nelineárním difúzním filtrování
Autoři
HUBENÝ, Jan (203 Česká republika, garant), Pavel MATULA (203 Česká republika), Petr MATULA (203 Česká republika) a Michal KOZUBEK (203 Česká republika)
Vydání
Berlin, Proceedings of PDE-Based Image Processing and Related Inverse Problems, od s. 163-173, 10 s. 2006
Nakladatel
Springer-Verlag
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Stať ve sborníku
Obor
10201 Computer sciences, information science, bioinformatics
Stát vydavatele
Německo
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Kód RIV
RIV/00216224:14330/06:00015590
Organizační jednotka
Fakulta informatiky
ISBN
3-540-33266-9
Klíčová slova anglicky
Nonlinear diffusion filtering; PDE based image processing; interphase chromosomes; biomedical application
Štítky
Příznaky
Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 18. 3. 2008 01:16, doc. RNDr. Pavel Matula, Ph.D.
V originále
A recently published method for 3D reconstruction of interphase chromosomes based on the fast marching method was extended. A kind of anisotropic diffusion filtering, namely the balanced forward-backward diffusion filtering, was added to the preprocessing phase of the algorithm. The method for finding an optimal arrival time was also modified. The anisotropic diffusion filtering can suppress inhomogeneities in chromosome staining while edges in images are preserved. This leads to better performance for chromosomes that are close to each other.
Česky
Nedávno publikovaná metoda na rekonstrukci chromozomů v interfázi využívající fast marching metodu byla rozšířena. BDo fáze předzpracování obrazových dat bylo přidáno nelineární difúzní filtrování, jmenovitě balanced backward forward fitrování. Metoda na hledání optimálního času příchodu byla také změněna. Nelineární difůze potlačuje nerovnoměrnosti v intenzitě chromozomů a zároveň zachovává jejich hrany. Toto vše vede k lepším výsledkům prezentované metody.
Návaznosti
| GP204/03/D034, projekt VaV |
| ||
| MSM0021622419, záměr |
|