HUBENÝ, Jan, Pavel MATULA, Petr MATULA a Michal KOZUBEK. Improved 3D Reconstruction of Interphase Chromosomes Based on Nonlinear Diffusion Filtering. In Proceedings of PDE-Based Image Processing and Related Inverse Problems. Berlin: Springer-Verlag, 2006, s. 163-173, 10 s. ISBN 3-540-33266-9.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Improved 3D Reconstruction of Interphase Chromosomes Based on Nonlinear Diffusion Filtering
Název česky Vylepšení 3D rekonstrukce chromosomů v interfázi založené na nelineárním difúzním filtrování
Autoři HUBENÝ, Jan (203 Česká republika, garant), Pavel MATULA (203 Česká republika), Petr MATULA (203 Česká republika) a Michal KOZUBEK (203 Česká republika).
Vydání Berlin, Proceedings of PDE-Based Image Processing and Related Inverse Problems, od s. 163-173, 10 s. 2006.
Nakladatel Springer-Verlag
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Stať ve sborníku
Obor 10201 Computer sciences, information science, bioinformatics
Stát vydavatele Německo
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Kód RIV RIV/00216224:14330/06:00015590
Organizační jednotka Fakulta informatiky
ISBN 3-540-33266-9
Klíčová slova anglicky Nonlinear diffusion filtering; PDE based image processing; interphase chromosomes; biomedical application
Štítky biomedical application, cbia-web, interphase chromosomes, Nonlinear diffusion filtering, PDE based image processing
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnil: doc. RNDr. Pavel Matula, Ph.D., učo 2927. Změněno: 18. 3. 2008 01:16.
Anotace
A recently published method for 3D reconstruction of interphase chromosomes based on the fast marching method was extended. A kind of anisotropic diffusion filtering, namely the balanced forward-backward diffusion filtering, was added to the preprocessing phase of the algorithm. The method for finding an optimal arrival time was also modified. The anisotropic diffusion filtering can suppress inhomogeneities in chromosome staining while edges in images are preserved. This leads to better performance for chromosomes that are close to each other.
Anotace česky
Nedávno publikovaná metoda na rekonstrukci chromozomů v interfázi využívající fast marching metodu byla rozšířena. BDo fáze předzpracování obrazových dat bylo přidáno nelineární difúzní filtrování, jmenovitě balanced backward forward fitrování. Metoda na hledání optimálního času příchodu byla také změněna. Nelineární difůze potlačuje nerovnoměrnosti v intenzitě chromozomů a zároveň zachovává jejich hrany. Toto vše vede k lepším výsledkům prezentované metody.
Návaznosti
GP204/03/D034, projekt VaVNázev: Trojrozměrná analýza buněčných jader s využitím obrazové cytometrie
Investor: Grantová agentura ČR, Trojrozměrná analýza buněčných jader s využitím obrazové cytometrie
MSM0021622419, záměrNázev: Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy
VytisknoutZobrazeno: 28. 8. 2024 19:22