Proteom polyvalentního stafylokokového bakteriofága

D 2006

Proteom polyvalentního stafylokokového bakteriofága

EYER, Luděk; Zbyněk ZDRÁHAL; Hana KONEČNÁ; Roman PANTŮČEK; Vladislava RŮŽIČKOVÁ et. al.

Základní údaje

Originální název

Proteom polyvalentního stafylokokového bakteriofága

Název anglicky

Proteome of the polyvalent staphylococcal bacteriophage

Autoři

EYER, Luděk (203 Česká republika); Zbyněk ZDRÁHAL (203 Česká republika); Hana KONEČNÁ (203 Česká republika); Roman PANTŮČEK (203 Česká republika); Vladislava RŮŽIČKOVÁ (203 Česká republika); Jan PREISLER (203 Česká republika); Lenka HERNYCHOVÁ (203 Česká republika) a Jiří DOŠKAŘ (203 Česká republika, garant)

Vydání

Brno, X. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů, s. 62-62, 2006

Nakladatel

Masarykova univerzita

Další údaje

Jazyk

čeština

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

URL

Kód RIV

RIV/00216224:14310/06:00015615

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

ISBN

80-210-3942-6

Klíčová slova anglicky

Staphylococcus aureus; bacteriophages; therapy; proteome; MALDI MS

Štítky

bacteriophages, MALDI MS, proteome, Staphylococcus aureus, THERAPY

Změněno: 8. 4. 2010 10:13, prof. Mgr. Jan Preisler, Ph.D.

Anotace

ORIG EN

V originále

Bakteriofág 812 je virulentní a polyvalentní fág, zástupce čeledi Myoviridae, který se vyznačuje širokým rozmezím hostitele zahrnujícím řadu druhů rodu Staphylococcus. Jeho genom je tvořen lineární dvouřetězcovou DNA o velikosti cca 145 kbp, která vykazuje vysoký stupeň sekvenční homologie s genomy fágů K a G1. Polyvalentní stafylokokové bakteriofágy se v posledních letech staly předmětem zájmu s ohledem na jejich možné praktické využití při fágové terapii, která představuje vhodnou alternativu antibiotikové léčby stafylokokových infekcí. Cílem práce je detailní charakterizace proteomu fága 812 a identifikace proteinů tvořících fágové viriony. Fág 812 byl pomnožen na kmeni S. aureus SA812, purifikován ultracentrifugací v gradientu CsCl a dialyzován proti vodě. DNA uvolněná z fágových částic byla odstraněna DNázou I. Fágové proteiny byly denaturovány a k jejich separaci byla použita 1-D a 2-D PAGE. Proteiny byly identifikovány metodou peptidového mapování s využitím MALDI TOF MS a LC MS/MS. Pomocí 1-D PAGE bylo nalezeno cca 40 pruhů v rozmezí 10 150 kDa. Pomocí 2-D PAGE bylo nalezeno cca 120 skvrn (gely barvené CBB) a cca 700 skrvn (gely barvené stříbrem). Peptidovým mapováním bylo identifikováno celkem 24 proteinů fága 812. Použití 2D-PAGE umožnilo identifikovat 20 nových proteinů, které dosud nebyly určeny při analýze proteomu blízce příbuzných stafylokokových fágů K a G1. 15 proteinů bylo jednoznačně přiřazeno ke genům náležejícím do strukturního genomového modulu, zbývajících 9 je kódováno geny levého nebo pravého ramena fágového genomu. Mezi nejvíce abundantní proteiny fága 812 patří hlavní kapsidový protein, hlavní protein bičíkové pochvy a dále ORF8 a protein identický s ORF 95 fága K. Protein bičíkové pochvy se vyskytuje ve dvou formách lišících se elektroforetickou mobilitou. Předpokládá se, že tyto změny ve struktuře proteinu souvisejí s kontrakcí fágového bičíku. Identifikované proteiny fága 812 tvoří základ pro detailní analýzu struktury fágových virionů a jsou předpokladem jejich účinného a bezpečného využití ve fágové terapii.

Anglicky

In this study, proteome of the polyvalent staphylococcal bacteriophage is characterized in detail

Návaznosti

GA203/03/0515, projekt VaV

Název: Integrovaná analýza genomu a proteomu terapeuticky významných bakteriofágů kombinací elektroforézy a hmotnostní spektrometrie

Investor: Grantová agentura ČR, Integrovaná analýza genomu a proteomu terapeuticky významných bakteriofágů kombinací elektroforézy a hmotnostní spektrometrie

MSM0021622415, záměr

Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Citovat

EYER, Luděk; Zbyněk ZDRÁHAL; Hana KONEČNÁ; Roman PANTŮČEK; Vladislava RŮŽIČKOVÁ; Jan PREISLER; Lenka HERNYCHOVÁ a Jiří DOŠKAŘ. Proteom polyvalentního stafylokokového bakteriofága. In X. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Brno: Masarykova univerzita, 2006, s. 62. ISBN 80-210-3942-6.

@inproceedings{627905,
   author = {Eyer, Luděk and Zdráhal, Zbyněk and Konečná, Hana and Pantůček, Roman and Růžičková, Vladislava and Preisler, Jan and Hernychová, Lenka and Doškař, Jiří},
   address = {Brno},
   booktitle = {X. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů},
   keywords = {Staphylococcus aureus; bacteriophages; therapy; proteome; MALDI MS},
   language = {cze},
   location = {Brno},
   isbn = {80-210-3942-6},
   pages = {62-62},
   publisher = {Masarykova univerzita},
   title = {Proteom polyvalentního stafylokokového bakteriofága},
   url = {http://orion.chemi.muni.cz/Setkani/setkani10/index.htm},
   year = {2006}
}

TY  - CONF
ID  - 627905
AU  - Eyer, Luděk - Zdráhal, Zbyněk - Konečná, Hana - Pantůček, Roman - Růžičková, Vladislava - Preisler, Jan - Hernychová, Lenka - Doškař, Jiří
PY  - 2006
TI  - Proteom polyvalentního stafylokokového bakteriofága
PB  - Masarykova univerzita
CY  - Brno
SN  - 8021039426
KW  - Staphylococcus aureus
KW  - bacteriophages
KW  - therapy
KW  - proteome
KW  - MALDI MS
UR  - http://orion.chemi.muni.cz/Setkani/setkani10/index.htm
N2  - Bakteriofág 812 je virulentní a polyvalentní fág, zástupce čeledi Myoviridae, který se vyznačuje širokým rozmezím hostitele zahrnujícím řadu druhů rodu Staphylococcus. Jeho genom je tvořen lineární dvouřetězcovou DNA o velikosti cca 145 kbp, která vykazuje vysoký stupeň sekvenční homologie s genomy fágů K a G1. Polyvalentní stafylokokové bakteriofágy se v posledních letech staly předmětem zájmu s ohledem na jejich možné praktické využití při fágové terapii, která představuje vhodnou alternativu antibiotikové léčby stafylokokových infekcí. Cílem práce je detailní charakterizace proteomu fága 812 a identifikace proteinů tvořících fágové viriony. Fág 812 byl pomnožen na kmeni S. aureus SA812, purifikován ultracentrifugací v gradientu CsCl a dialyzován proti vodě. DNA uvolněná z fágových částic byla odstraněna DNázou I. Fágové proteiny byly denaturovány a k jejich separaci byla použita 1-D a 2-D PAGE. Proteiny byly identifikovány metodou peptidového mapování s využitím MALDI TOF MS a LC MS/MS. Pomocí 1-D PAGE bylo nalezeno cca 40 pruhů v rozmezí 10 150 kDa. Pomocí 2-D PAGE bylo nalezeno cca 120 skvrn (gely barvené CBB) a cca 700 skrvn (gely barvené stříbrem). Peptidovým mapováním bylo identifikováno celkem 24 proteinů fága 812. Použití 2D-PAGE umožnilo identifikovat 20 nových proteinů, které dosud nebyly určeny při analýze proteomu blízce příbuzných stafylokokových fágů K a G1. 15 proteinů bylo jednoznačně přiřazeno ke genům náležejícím do strukturního genomového modulu, zbývajících 9 je kódováno geny levého nebo pravého ramena fágového genomu. Mezi nejvíce abundantní proteiny fága 812 patří hlavní kapsidový protein, hlavní protein bičíkové pochvy a dále ORF8 a protein identický s ORF 95 fága K. Protein bičíkové pochvy se vyskytuje ve dvou formách lišících se elektroforetickou mobilitou. Předpokládá se, že tyto změny ve struktuře proteinu souvisejí s kontrakcí fágového bičíku. Identifikované proteiny fága 812 tvoří základ pro detailní analýzu struktury fágových virionů a jsou předpokladem jejich účinného a bezpečného využití ve fágové terapii.
ER  -

EYER, Luděk; Zbyněk ZDRÁHAL; Hana KONEČNÁ; Roman PANTŮČEK; Vladislava RŮŽIČKOVÁ; Jan PREISLER; Lenka HERNYCHOVÁ a Jiří DOŠKAŘ. Proteom polyvalentního stafylokokového bakteriofága. In \textit{X. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů}. Brno: Masarykova univerzita, 2006, s.~62. ISBN~80-210-3942-6.

Přehled o publikaci