Molekulární typizace bakterií rodu Lactobacillus pomocí rep-PCR

DUŠKOVÁ, Marta, Alena ŠPANOVÁ a Bohuslav RITTICH. Molekulární typizace bakterií rodu Lactobacillus pomocí rep-PCR. In X. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Brno: Masarykova univerzita, 2006, s. 105-105. ISBN 80-210-3942-6.

Základní údaje

• Originální název: Molekulární typizace bakterií rodu Lactobacillus pomocí rep-PCR
• Název anglicky: Molecular typization of bacteria of Lactobacillus genera using rep-PCR
• Autoři: DUŠKOVÁ, Marta (203 Česká republika), Alena ŠPANOVÁ (203 Česká republika, garant) a Bohuslav RITTICH (203 Česká republika).
• Vydání: Brno, X. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů, od s. 105-105, 1 s. 2006.
• Nakladatel: Masarykova univerzita

Další údaje

• Originální jazyk: čeština
• Typ výsledku: Stať ve sborníku
• Obor: 10600 1.6 Biological sciences
• Stát vydavatele: Česká republika
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• Kód RIV: RIV/00216224:14310/06:00016655
• Organizační jednotka: Přírodovědecká fakulta
• ISBN: 80-210-3942-6
• Klíčová slova anglicky: Typization; rep-PCR ; Lactobacillus
• Štítky: Lactobacillus, rep-PCR, Typization

Anotace

Cílem práce byla typizace BMK rodu Lactobacillus s využitím metody rep-PCR. V experimentech byla použita DNA, izolovaná z 38 sbírkových kmenů Lactobacillus a 20 nových izolátů bakterií rodu Lactobacillu lidského původu. DNA byla izolována metodou fenolové extrakce. Koncentrace a čistota DNA byla stanovena spektrofotometricky. Kvalita purifikované DNA byla ověřena pomocí agarózové gelové elektroforézy a pomocí PCR s rodově specifickými primery LbLMA 1-rev a R16-1 (Dubernet a spol., 2002). Typizace bakterií rodu Lactobacillus byla prováděna pomocí rep-PCR s primerem (GTG)5 (Gevers a spol., 2001). Bylo zjištěno, že testovaný soubor bakterií rodu Lactobacillus lze rozdělit do skupin, které odrážejí jejich mezidruhovou heterogenitu.

Anotace anglicky

The aim of the work was the use of rep-PCR for molecular typisation of lactic acid bacteria of genus Lactobacillus. Alltogether 38 collection strains and 20 new isolated strains (of human origin) were used in experiments. DNA was isolated using phenol extraction method. Concentration and purity of DNA was estimated spectrophotometrically. The quality of purified DNA was proved using agarose gel electrophoresis and using PCR with genus specific primers LbLMA 1-rev and R16-1 (Duberbet et al., 2002). Typisation of bacteria of genus Lactobacillus was carried out using rep-PCR primer (GTG)5 (Gevers et al. 2001). Tested bacterial strains of genus Lactobacillus can be divided into groups which reflect their intraspecies heterogenity.

Návaznosti

• MSM0021622415, záměr: Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

• 1G46045, projekt VaV: Název: Molekulárně biologická analýza tuzemského fondu produkčních kmenů baktérií mléčného kvašení.

Investor: Ministerstvo zemědělství ČR, Molekulárně biologická analýza tuzemského fondu produkčních kmenů bakterií mléčného kvašení