D 2006

Molekulární typizace bakterií rodu Lactobacillus pomocí rep-PCR

DUŠKOVÁ, Marta, Alena ŠPANOVÁ and Bohuslav RITTICH

Basic information

Original name

Molekulární typizace bakterií rodu Lactobacillus pomocí rep-PCR

Name (in English)

Molecular typization of bacteria of Lactobacillus genera using rep-PCR

Authors

DUŠKOVÁ, Marta (203 Czech Republic), Alena ŠPANOVÁ (203 Czech Republic, guarantor) and Bohuslav RITTICH (203 Czech Republic)

Edition

Brno, X. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů, p. 105-105, 1 pp. 2006

Publisher

Masarykova univerzita

Other information

Language

Czech

Type of outcome

Stať ve sborníku

Field of Study

10600 1.6 Biological sciences

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

RIV identification code

RIV/00216224:14310/06:00016655

Organization unit

Faculty of Science

ISBN

80-210-3942-6

Keywords in English

Typization; rep-PCR ; Lactobacillus
Změněno: 1/10/2007 15:11, doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.

Abstract

V originále

Cílem práce byla typizace BMK rodu Lactobacillus s využitím metody rep-PCR. V experimentech byla použita DNA, izolovaná z 38 sbírkových kmenů Lactobacillus a 20 nových izolátů bakterií rodu Lactobacillu lidského původu. DNA byla izolována metodou fenolové extrakce. Koncentrace a čistota DNA byla stanovena spektrofotometricky. Kvalita purifikované DNA byla ověřena pomocí agarózové gelové elektroforézy a pomocí PCR s rodově specifickými primery LbLMA 1-rev a R16-1 (Dubernet a spol., 2002). Typizace bakterií rodu Lactobacillus byla prováděna pomocí rep-PCR s primerem (GTG)5 (Gevers a spol., 2001). Bylo zjištěno, že testovaný soubor bakterií rodu Lactobacillus lze rozdělit do skupin, které odrážejí jejich mezidruhovou heterogenitu.

In English

The aim of the work was the use of rep-PCR for molecular typisation of lactic acid bacteria of genus Lactobacillus. Alltogether 38 collection strains and 20 new isolated strains (of human origin) were used in experiments. DNA was isolated using phenol extraction method. Concentration and purity of DNA was estimated spectrophotometrically. The quality of purified DNA was proved using agarose gel electrophoresis and using PCR with genus specific primers LbLMA 1-rev and R16-1 (Duberbet et al., 2002). Typisation of bacteria of genus Lactobacillus was carried out using rep-PCR primer (GTG)5 (Gevers et al. 2001). Tested bacterial strains of genus Lactobacillus can be divided into groups which reflect their intraspecies heterogenity.

Links

MSM0021622415, plan (intention)
Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations
1G46045, research and development project
Name: Molekulárně biologická analýza tuzemského fondu produkčních kmenů baktérií mléčného kvašení.
Investor: Ministry of Agriculture of the CR, Introduction of new traits for quality and stability improving in variety production of selcted leguminous species by hybridization methods