Molekulární typizace bakterií rodu Lactobacillus pomocí rep-PCR

DUŠKOVÁ, Marta, Alena ŠPANOVÁ and Bohuslav RITTICH. Molekulární typizace bakterií rodu Lactobacillus pomocí rep-PCR (Molecular typization of bacteria of Lactobacillus genera using rep-PCR). In X. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Brno: Masarykova univerzita, 2006, p. 105-105. ISBN 80-210-3942-6.

Basic information

• Original name: Molekulární typizace bakterií rodu Lactobacillus pomocí rep-PCR
• Name (in English): Molecular typization of bacteria of Lactobacillus genera using rep-PCR
• Authors: DUŠKOVÁ, Marta (203 Czech Republic), Alena ŠPANOVÁ (203 Czech Republic, guarantor) and Bohuslav RITTICH (203 Czech Republic).
• Edition: Brno, X. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů, p. 105-105, 1 pp. 2006.
• Publisher: Masarykova univerzita

Other information

• Original language: Czech
• Type of outcome: Proceedings paper
• Field of Study: 10600 1.6 Biological sciences
• Country of publisher: Czech Republic
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• RIV identification code: RIV/00216224:14310/06:00016655
• Organization unit: Faculty of Science
• ISBN: 80-210-3942-6
• Keywords in English: Typization; rep-PCR ; Lactobacillus
• Tags: Lactobacillus, rep-PCR, Typization

Abstract

Cílem práce byla typizace BMK rodu Lactobacillus s využitím metody rep-PCR. V experimentech byla použita DNA, izolovaná z 38 sbírkových kmenů Lactobacillus a 20 nových izolátů bakterií rodu Lactobacillu lidského původu. DNA byla izolována metodou fenolové extrakce. Koncentrace a čistota DNA byla stanovena spektrofotometricky. Kvalita purifikované DNA byla ověřena pomocí agarózové gelové elektroforézy a pomocí PCR s rodově specifickými primery LbLMA 1-rev a R16-1 (Dubernet a spol., 2002). Typizace bakterií rodu Lactobacillus byla prováděna pomocí rep-PCR s primerem (GTG)5 (Gevers a spol., 2001). Bylo zjištěno, že testovaný soubor bakterií rodu Lactobacillus lze rozdělit do skupin, které odrážejí jejich mezidruhovou heterogenitu.

Abstract (in English)

The aim of the work was the use of rep-PCR for molecular typisation of lactic acid bacteria of genus Lactobacillus. Alltogether 38 collection strains and 20 new isolated strains (of human origin) were used in experiments. DNA was isolated using phenol extraction method. Concentration and purity of DNA was estimated spectrophotometrically. The quality of purified DNA was proved using agarose gel electrophoresis and using PCR with genus specific primers LbLMA 1-rev and R16-1 (Duberbet et al., 2002). Typisation of bacteria of genus Lactobacillus was carried out using rep-PCR primer (GTG)5 (Gevers et al. 2001). Tested bacterial strains of genus Lactobacillus can be divided into groups which reflect their intraspecies heterogenity.

Links

• MSM0021622415, plan (intention): Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations

• 1G46045, research and development project: Name: Molekulárně biologická analýza tuzemského fondu produkčních kmenů baktérií mléčného kvašení.

Investor: Ministry of Agriculture of the CR, Introduction of new traits for quality and stability improving in variety production of selcted leguminous species by hybridization methods