2006
DETEKCE GENU PROSTŘEDNICTVÍM MUTACE LYCOPODIOFORMIS u Arabidopsis thaliana
KOLOUCHOVÁ, Tereza, Jana ŘEPKOVÁ, Pavel LÍZAL a Jiřina RELICHOVÁZákladní údaje
Originální název
DETEKCE GENU PROSTŘEDNICTVÍM MUTACE LYCOPODIOFORMIS u Arabidopsis thaliana
Název česky
DETEKCE GENU PROSTŘEDNICTVÍM MUTACE LYCOPODIOFORMIS u Arabidopsis thaliana
Název anglicky
Gene detection in Arabidopsis thaliana by means of lycopodioformis mutation
Autoři
KOLOUCHOVÁ, Tereza (203 Česká republika, domácí), Jana ŘEPKOVÁ (203 Česká republika, garant, domácí), Pavel LÍZAL (203 Česká republika, domácí) a Jiřina RELICHOVÁ (203 Česká republika, domácí)
Vydání
X. pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2006
Další údaje
Jazyk
čeština
Typ výsledku
Konferenční abstrakt
Obor
Genetika a molekulární biologie
Stát vydavatele
Česká republika
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Kód RIV
RIV/00216224:14310/06:00016656
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
ISBN
80-210-3942-6
Klíčová slova anglicky
Arabidopsis; mapping; mutation; gene identification
Štítky
Změněno: 11. 4. 2011 18:23, Mgr. Tereza Dobisová, Ph.D.
V originále
V posledních patnácti letech bylo úsilí biologů zaměřeno na studium a porozumění molekulární podstaty vývojových procesů rostlin a na identifikaci a charakterizaci nových genů. V této oblasti hrála Arabidopsis thaliana důležitou úlohu jako nejvýznamnější rostlinný modelový organismus. Je to první rostlinný druh, jehož genom byl osekvencován, ale znalosti o funkcích jednotlivých genů jsou dosud malé. Rozvíjí se nové metody mutageneze a molekulárně genetické strategie pro charakterizaci mutací a izolaci genů. Cílem naší studie byla charakterizace mutace lycopodioformis (ly) vytvořené na genetickém pozadí S96 chemomutagenem ethylmetansulfonát v laboratoři Molekulární genetiky rostlin MU v Brně a identifikace genu prostřednictvím lokalizace mutantní alely do genetické mapy Arabidopsis thaliana. Mutace ly je vývojová mutace, pro kterou je charakteristický zakrslý vzrůst, rané kvetení, okoličnaté květenství. Mutace ly je determinována jedním genem; jedná se o recesivní mutaci štěpící v poměru 3:1. Mutantní alela ly byla lokalizována do genetické mapy prostřednictvím rekombinační analýzy v generaci F2 a DNA markerů SSR (simple sequence repeat), CAPS (cleaved amplified polymorphic sequence) a AFLP (amplified fragment length polymorphism). Mutace byla lokalizována na začátek chromozomu 5 ve vazbě s markery CIW15, MUK11D (3,9 cM) a nga 225 (5,2 cM). Na dlouhém rameni chromozomu 1 byla zachycena vazba mutace ly s markerem T27K12-SP6 (10,8 cM). Z dostupných databází byly vytipovány kandidátní geny SDR1 (celý název genu) na chromozomu 1, RTM2, SDR a TFL1 na chromozomu 5. Gen na chromozomu 1 pravděpodobně modifikuje funkci genu lokalizovaného na chromozomu 5.
Anglicky
The aim of the work was the characterization of lycopodioformis mutation and candidate gene detection by fine genetic mapping.
Návaznosti
| MSM0021622415, záměr |
|