D 2006

Resolution of overlapped reduction signals in short hetero-oligonucleotides by elimination voltammetry

TRNKOVÁ, Libuše, Radka MIKELOVÁ, František JELEN, Vojtch ADAM, René KIZEK et. al.

Základní údaje

Originální název

Resolution of overlapped reduction signals in short hetero-oligonucleotides by elimination voltammetry

Název česky

Rozdlení redukčních signál krátkých hetero-oligonukleotidů pomocí eliminační voltametrie

Autoři

TRNKOVÁ, Libuše (203 Česká republika, garant), Radka MIKELOVÁ (203 Česká republika), František JELEN (203 Česká republika), Vojtch ADAM (203 Česká republika) a René KIZEK (203 Česká republika)

Vydání

první. Bordeaux, 11th International conference on electroanalysis, od s. 6-6, 1 s. 2006

Nakladatel

European Society for ElectroAnalytical Chemistry

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

10405 Electrochemistry

Stát vydavatele

Francie

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Kód RIV

RIV/00216224:14310/06:00019327

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

UT WoS

000244220700032

Klíčová slova anglicky

Electrochemistry; Hetero-oligonucleotides; Mercury electrode; Elimination voltammetry with linear scan;
Změněno: 20. 6. 2008 13:01, prof. RNDr. Libuše Trnková, CSc.

Anotace

V originále

Introduction. Recently, the elimination voltammetry with linear scan (EVLS) was successfully applied to data analysis of oligodeoxynucleotides (ODNs) signal, aiming on better understanding of basic electrochemical processes on working electrode surfaces, and for better resolution of voltammetric signals of adenine and cytosine in ODNs. The EVLS provides a significant increase of voltammetric signal sensitivity. Materials and methods. Linear sweep voltammetry (LSV) measurements were performed with an AUTOLAB analyzer (EcoChemie, Netherlands) connected to the VA-Stand 663 (Metrohm). The electrochemical standard cell consisted of three electrodes. The working electrode was a hanging mercury drop electrode; the reference electrode was Ag/AgCl/3M KCl. Platinum wire was used as an auxiliary electrode. The adsorption of ODNs was carried out at 0.1 V for accumulation time of 120 s under stirring. For the elimination procedure three different scan rates were used. Results. We applied elimination voltammetry with linear scan to the resolution of reduction signals of adenine and cytosine residues in short synthetic hetero-oligodeoxynucleotides with different sequences of adenine and cytosine. The EVLS is capable of resolving the overlapped adenine and cytosine signals, specifically by using the elimination function which eliminates the charging and kinetic currents and conserves the diffusion current. This function provides the special peak-counterpeak signal which increases the current sensitivity for adenine and cytosine resolution. It was found that heights and potentials of voltammetric signals were affected by ODNs concentrations, pH, scan rates, time of accumulation, and stirring speed during the adsorption. While on linear sweep curves the only reduction peak of adenine and cytosine residues was observed in all ODNs, the EVLS yielded two separated peaks in dependence on adenine and cytosine sequences and pH. Conclusions. The EVLS offers a new tool for very good resolution of these bases in ODNs, and for a qualitative and quantitative sensing device for changes in the primary structure of ODN chains. It can be expected that in case of identical number of reducible bases the technique will even make it possible to distinguish between neighbouring and non-neighbouring bases.

Česky

Rozdlení redukčních signál krátkých hetero-oligonukleotidů pomocí eliminační voltametrie

Návaznosti

GP525/04/P132, projekt VaV
Název: Studium obranných mechanismů rostlin při stresu způsobeném těžkými kovy
IAA100040602, projekt VaV
Název: Nové přístupy v elektrochemické analýze nukleových kyselin a oligonukleotidů zaměřené na ultrasensitivní mikrodetekci DNA a detekci DNA hybridizace.
Investor: Akademie věd ČR, Nové přístupy v elektrochemické analýze nukleových kyselin a oligonukleotidů zaměřené na ultrasensitivní mikrodetekci DNA a detekci DNA hybridizace
MSM0021622412, záměr
Název: Interakce mezi chemickými látkami, prostředím a biologickými systémy a jejich důsledky na globální, regionální a lokální úrovni (INCHEMBIOL) (Akronym: INCHEMBIOL)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Interakce mezi chemickými látkami, prostředím a biologickými systémy a jejich důsledky na globální , regionální a lokální úrovni