J 2006

Genetic structure among and within peripheral and central populations of three endangered floodplain violets

ECKSTEIN, R. L., R. A. O'NEIL, Jiří DANIHELKA, A. OTTE, W. KÖHLER et. al.

Základní údaje

Originální název

Genetic structure among and within peripheral and central populations of three endangered floodplain violets

Název česky

Genetická struktura periferních a centrálních populací tří ohrožených druhů nivních violek

Autoři

ECKSTEIN, R. L. (276 Německo), R. A. O'NEIL (276 Německo), Jiří DANIHELKA (203 Česká republika, garant), A. OTTE (276 Německo) a W. KÖHLER (276 Německo)

Vydání

Molecular Ecology, Blackwell Publishing Ltd. 2006, 0962-1083

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Velká Británie a Severní Irsko

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 4.825

Kód RIV

RIV/00216224:14310/06:00017001

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

UT WoS

000239010000006

Klíčová slova anglicky

AFLP; conservation; genetic diversity; marginal populations; spatial genetic structure; Viola

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 18. 12. 2006 13:30, Ing. Jiří Danihelka, Ph.D.

Anotace

V originále

AFLP (4 primer combinations) was analysed in 950 individuals of 50 populations. Marginal populations were smaller and were more isolated in two species. Differentiation was stronger, genetic diversity and gene flow lower in marginal populations of the two more isolated species. Species-specific differences in genetic structure were related to effects of fragmentation. Variation between regions (3-6%), among (30-37%) and within populations (60-64%) was significant. Marginal populations lacked loci that were rare and localised in core populations. Loss of widespread loci in marginal Viola stagnina populations indicated genetic erosion. Autocorrelation within populations was statistically significant up to 10-20 m. Peripheral populations contributed significantly to genetic variation and contained unique loci, which made them important for the conservation of genetic diversity. There were no significant correlations between molecular variance and population size or isolation.

Česky

AFLP (4 kombinace primerů) byl analyzován u 950 jedinců z 50 populací. U dvou druhů byly marginální populace izolovanější. Diferenciace byla větší, genetická diverzita a tok genů byly menší u periferních populací dvou izolovanějších druhů. Druhově specifické rozdíly v genetické struktuře byly spojeny s vlivem fragmentace. Variabilita mezi oblastmi (3-6%), mezi populacemi (30-37%) a uvnitř populací (60-64%) byla signifikantní. Okrajové populace postrádaly lokusy, které byly v jádrových populacích vzácné nebo se vyskytovaly jen omozeně. Ztrátu hojně rozšířených lokusů u marginálních populací druhu Viola stagnina lze vysvětlit genetickou erozí. Prostorová autokorelace uvnitř populací byla statisticky významná na vzdálenost do 10-20 m. Periferní populace význymně přispívají ke genetické proměnlivosti a obsahují unikátní lokusy, a proto jsou důležité pro ochranu genetické diverzity. Nebyla zjištěna signifikantní korelace mezi molekulární proměnlivostí a velikostí populace nebo mírou izolace.

Návaznosti

MSM0021622416, záměr
Název: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Diverzita biotických společenstev: kauzální analýza variability v prostoru a čase