J 2007

Dynamics of nuclear transcription autoregulation: Bifurcation and periodic solutions in a negative feedback loop with delay

POKOJSKÁ, Eva and Rachid OUIFKI

Basic information

Original name

Dynamics of nuclear transcription autoregulation: Bifurcation and periodic solutions in a negative feedback loop with delay

Name in Czech

Dynamika autoregulace jaderné transkripce: Bifurkace a periodická řešení v negativní zpětnovazebné smyčce se zpožděním

Authors

POKOJSKÁ, Eva (203 Czech Republic, guarantor) and Rachid OUIFKI (504 Morocco)

Edition

Physica D - Nonlinear Phenomena, North-Holland, Elsevier, 2007, 0167-2789

Other information

Language

English

Type of outcome

Článek v odborném periodiku

Field of Study

10201 Computer sciences, information science, bioinformatics

Country of publisher

Netherlands

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

References:

Impact factor

Impact factor: 1.735

RIV identification code

RIV/00216224:14110/07:00024119

Organization unit

Faculty of Medicine

Keywords in English

Delayed negative feedback; Stability and periodic solutions; Global attractor; Differentiation clock

Tags

Tags

International impact, Reviewed
Změněno: 14/1/2010 15:42, MUDr. Eva Pokojská

Abstract

ORIG CZ

V originále

Controlled timing of cell death in early development results in rhythmic segment formation during multicellular body prolongation. The process is regulated intracellularly, by transient oscillatory expression of nuclear transcription regulators, and can be modeled by a simple negative feedback loop. Role of transport/processing delay on stability, bifurcation direction, periodic solutions, and global attractor structure is analyzed for the unstable phase space region, bounded below by reaction nonlinearities and production/decay rates. Existence of two functionally different classes of dynamic transcription regulators is conjectured from the theoretical results.

In Czech

Časová kontrola buněčné smrti během raného vývoje organismu má za následek formování segmentů v průběhu prodlužování těla mnohobuněčného organismu. Vnitrobuněčné řízení tohoto procesu je založeno na dočasně oscilující expresi jaderných transkripčních regulátorů, a lze jej modelovat pomocí jednoduché negativní zpětné vazby. Práce analyzuje (de)stabilizující roli zpoždění během transportu a zpracování, směr bifurkace, existující periodická řešení, jakož i strukturu globálniho atraktoru v nestabilním parametrovém prostoru, ohraničeném zezdola reakčními nelinearitami a rychlostí vzniku/rozpadu produktu. Z teoretických výsledků lze usuzovat na existenci dvou funkčně odlišných tříd dynamických transkripčních regulátorů.

Links

AV0Z60870520, plan (intention)
Name: Prostorová a funkční dynamika biologických, ekologických a sociálně-ekonomických systémů v interakci s Globální změnou klimatu
MSM 141100002, plan (intention)
Name: Molekulární patofyziologie multigenních chorob
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular pathophysiology of multigene diseases
MSM6007665808, plan (intention)
Name: Fyzikální biologie -nové přístupy v biologickém výzkumu