2004
Nový častý polymorfismu 17654 C/T v genu pro trankripční represorový onkoprotein Gfi-1 u kožních T-lymfomů
BIENERTOVÁ VAŠKŮ, Julie a Vladimír VAŠKŮZákladní údaje
Originální název
Nový častý polymorfismu 17654 C/T v genu pro trankripční represorový onkoprotein Gfi-1 u kožních T-lymfomů
Název anglicky
New 3´-UTR mutation in Gfi-1 gene is associated with cutaneous T-cell lymphoma
Autoři
BIENERTOVÁ VAŠKŮ, Julie (203 Česká republika, garant) a Vladimír VAŠKŮ (203 Česká republika)
Vydání
Praha, Sborník XXI. Sjezdu českých a slovenských alergologů a klinických imunologů, Brno, 2004, supp 2, od s. 58-58, 1 s. 2004
Nakladatel
Tigis
Další údaje
Jazyk
čeština
Typ výsledku
Stať ve sborníku
Obor
Genetika a molekulární biologie
Stát vydavatele
Česká republika
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Kód RIV
RIV/00216224:14110/04:00021719
Organizační jednotka
Lékařská fakulta
Klíčová slova anglicky
gene; Gfi-1; cutaneous T-cell lymphoma
Štítky
Změněno: 1. 11. 2006 17:03, prof. MUDr. Julie Dobrovolná, Ph.D.
V originále
Úvod: Gfi-1 kóduje transkripční represorový onkoprotein, původně i dentifikovaný inzerční mutagenezou s užitím retrovirových vektorů v myších T-lymfomech. Cílem práce bylo asociovat nově objevený polymorfismus 1765 C->T s výskytem kožních T-lymfomů v české populaci. Materiál a metody: Heteroduplexní analýzou potvrzenou kapilární i radioizotovou sekvenací jsme prokázali nový, dosud nepublikovaný polymorfismus 1765 C->T ve 3 oblasti genu pro Gfi-1. Následně jsme vyvinuli PCR metodu s restrikční analýzou pomocí enzymu AvrII, která umožňuje rychlou detekci tohoto polymorfismu na širších klinických souborech. Srovnali jsme genotypové distribuce a alelické frekvence tohoto polymorfismu mezi skupinou 61 pacientů s kožními T-lymfomy a skupinou 93 zdravých jedinců podobné struktury věku a pohlaví. Výsledky: Neprokázali jsme signifikantní rozdíl v alelických frekvencích vyšetřeného polymorfismu 1765 CT mezi pacienty s kožním T-lymfomem (T= 36.9%) oproti kontrolním osobám (T=44.1%; p=0.209). Neprokázali jsme ani signifikantní rozdíl v distribuci genotypů mezi pacienty s T-lymfomy a kontrolními subjekty (p=0.227, tab. 1). Prokázali jsme však, že odds ratio (OR) pro genotyp TT u pacientů s kožním T-lymfomem je 0.510, 95% CI=0.22-1.14, p=0.07. Genotyp TT polymorfismu 1765 CT v Gfi-1 genu tedy představuje potenciálně protektivní variantu pro kožní T-lymfom. Závěr: Předpokládá se, že Gfi-1 působí jako dominantní onkogen, který kooperuje s Myc a Pim-1 v procesu vzniku lymfomů. U alelické varianty T 1765 C->T polymorfismu dochází k zániku vazebného místa pro aktivátorový protein 1 (AP-1) ve 3 oblasti. Je zajímavé, že homozygotní genotyp pro tuto alelickou variantu (TT) je zřejmě asociován s nižším OR pro kožní T-lymfom.
Anglicky
Gfi-1 encodes transcriptional repressor oncoprotein identified by a retroviral insertion mutagenesis screen for tumor progression in mouse T-cell lymphoma lines. The aim of our study was to test the association of novel 1765 C/T polymorphism with CTCL in the Czech population. Materials and methods: We identified alteration in Gfi-1 non-coding 3- sequence that proved to be the 1765 C/T transition using heteroduplex analysis followed by capillary as well as radioisotopic sequencing. A simple PCR method with restriction analysis using AvrII enzyme was developed for the rapid and simple detection of this new polymorphism. The genotype distributions as well as allelic frequencies of the polymorphism were compared between 61 patients with CTCL and a group of 93 healthy individuals of similar age and gender distribution. Results: No significant difference in allelic frequencies of examined polymorphism 1765 C->T in patients with CTCL (T= 36.9) against the control subjects (T= 44.1) was proved (P=0.209). Similarly, no significant difference in the genotype distributions of the examined polymorphism between the patients with CTCL and the controls was found (p=0.227). However, the lower odds ratio for the TT genotype in CTCL patients compared to control subjects was observed (OR=0.546, 95% confidential interval=0.22-1.14, p=0.07). Discussion: The allelic variant T of 1765 C/T polymorphism is characterized by extinction of the binding site for AP-1 protein in 3 - region of Gfi-1 gene. The homozygote genotype TT seems to be associated with lower OR for CTCL. Therefore, the TT genotype of 1765 C->T polymorphism of Gfi-1 gene may have potentially protective effect against CTCL.
Návaznosti
| MSM 141100002, záměr |
|