Detailed Information on Publication Record
2006
Molekulárně-biologická diagnostika spirochety Treponema pallidum v biologickém materiálu.
FLASAROVÁ, Magdalena, Petra MATĚJKOVÁ, David ŠMAJS and Vladana WOZNICOVÁBasic information
Original name
Molekulárně-biologická diagnostika spirochety Treponema pallidum v biologickém materiálu.
Name in Czech
Molekulárně-biologická diagnostika spirochety Treponema pallidum v biologickém materiálu.
Name (in English)
Molecular detection and subtyping of Treponema pallidum subsp. pallidum in clinical specimens
Authors
FLASAROVÁ, Magdalena (203 Czech Republic), Petra MATĚJKOVÁ (203 Czech Republic), David ŠMAJS (203 Czech Republic, guarantor) and Vladana WOZNICOVÁ (203 Czech Republic)
Edition
Brno, X. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků. p. 7-7, 2006
Publisher
Masarykova univerzita v Brně
Other information
Language
Czech
Type of outcome
Stať ve sborníku
Field of Study
Genetics and molecular biology
Country of publisher
Czech Republic
Confidentiality degree
není předmětem státního či obchodního tajemství
RIV identification code
RIV/00216224:14110/06:00016052
Organization unit
Faculty of Medicine
ISBN
80-210-3942-6
Keywords in English
Treponema pallidum subsp. pallidum; detection in clinical specimens; molecular typing; mucocutaneous swabs.
Tags
Změněno: 6/12/2006 13:04, prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D.
V originále
Prováděli jsme izolaci a detekci treponemální DNA (mikroorganismu Treponema pallidum subsp. pallidum) z různých klinických materiálů. Získaný biologický materiál jsme vyšetřili u pacientů s podezřením na syfilis, a to ve stádiu primárním, sekundárním, časně latentním a pozdně latentním včetně kongenitální syfilis. Klinické vzorky zahrnovaly kožní a slizniční stěry, séra, krevní sraženiny, likvory a tkáně. Celkem jsme vyšetřili 179 klinických vzorků, z toho 141 sér, 26 stěrů, 10 krevních sraženin, 1 likvor a 1 tkáň. Z tohoto výčtu vzorků jsme nalezli 7 pozitivních stěrů od 4 pacientů ve stádiu primární a sekundární syfilis. Dále jsme u novorozence s kongenitální syfilis prokázali tyto pozitivní vzorky: 1 likvor, 1 sérum a 1 stěr. U všech vyšetřovaných vzorků jsme provedli detekci treponemální DNA pomocí dvoukrokové (nested) PCR (polymerázové řetězové reakce) na gen tmpC (TP0319, kódující membránový lipoprotein). PCR produkty (z genu TP0319) o velikosti 451 bp jsme štěpili pomocí 3 restriktáz, Sac I, Nhe I, Dde I, k odlišení jednotlivých kmenů Treponema pallidum. Pro přesnou kmenovou typizaci jsme amplifikovali geny TP0548, TP0136, TP0319 a vzniklé PCR produkty sekvenovali.Výsledky sekvenací ve dvou případech ukázaly výskyt kmene sekvenčně totožného s kmenem SS14 a v dalších dvou případech jsme nalezli sekvenční změny v lokusech TP0548 a TP0136, které prokázaly výskyt unikátních syfilitických kmenů, doposud nepopsaných u Treponema pallidum subsp. pallidum. U jednoho vyšetřovaného novorozence jsme porovnali počet molekul DNA ve 2 různých biologických materiálech (v séru a v likvoru).
In English
A nested PCR amplification protocol detecting tmpC gene (TP0319, encoding putative membrane lipoprotein) was used for detection of Treponema pallidum subsp. pallidum in the clinical material. We tested 138 samples of blood sera of 111 adult patients in primary, secondary, early and late latent stages of the infection as well as of patients suspected of syphilis. T. p. pallidum DNA was not detected in any of the analyzed sera samples. Out of 11 mucocutaneous swabs (7 genital and 4 pharyngeal ones), 6 from 3 patients with primary or secondary syphilis were positive. In addition, one skin swab was positive in patient with early congenital syphilis. Sera and cerebrospinal fluid samples from this patient were also positive. DNA sequencing of genes TP0136 and TP0548 in the positive samples revealed two patients with DNA sequence identical to T. p. pallidum strain SS14 and two unique, not yet known T. p. pallidum strains. The advances in molecular typing of T. p. pallidum in clinical material will become important for epidemiologic consequences and for clinical discrimination between reinfection and reactivation of the syphilitic process.
Links
| GA310/04/0021, research and development project |
| ||
| MSM0021622415, plan (intention) |
| ||
| NR8967, research and development project |
|