Identifikace a charakterizace sigma-54 závislých promotorů Treponema pallidum.

ČEJKOVÁ, Darina a David ŠMAJS. Identifikace a charakterizace sigma-54 závislých promotorů Treponema pallidum. In Tomáškovy dny 2006. Sborník abstraktů. 2006.

Základní údaje

• Originální název: Identifikace a charakterizace sigma-54 závislých promotorů Treponema pallidum.
• Název anglicky: Identification and characterization of sigma-54-dependent promoters of Treponema pallidum.
• Autoři: ČEJKOVÁ, Darina (203 Česká republika) a David ŠMAJS (203 Česká republika, garant).
• Vydání: Tomáškovy dny 2006. Sborník abstraktů. 2006.

Další údaje

• Originální jazyk: čeština
• Typ výsledku: Konferenční abstrakt
• Obor: Genetika a molekulární biologie
• Stát vydavatele: Česká republika
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• Kód RIV: RIV/00216224:14110/06:00016081
• Organizační jednotka: Lékařská fakulta
• Klíčová slova anglicky: sigma-54-dependent promoters; Treponema pallidum.
• Štítky: sigma-54-dependent promoters, Treponema pallidum.

Anotace

Spirocheta T. pallidum ssp. pallidum je původcem syfilis, pohlavního onemocnění charakterizovaného více stádii a postižením různých orgánů. Je tedy pravděpodobné, že T. pallidum mění expresi svých genů během infekce lidského hostitele. Studovali jsme funkci faktoru sigma-54 (RpoN) a jeho promotorů. Funkcí sigma faktorů je vazba RNA–polymerázy k promotoru a specifická iniciace transkripce. Pro studium promotorů závislých na faktoru sigma-54 byla použita analýza in silico pomocí programu PromScan a transkripční fúze mezi promotory a geny luxCDABE plazmidu pCS26. Za přítomnosti dalšího plazmidu nesoucího treponemální gen pro sigma-54 (rpoN) můžeme pomocí tohoto systému analyzovat funkci jednotlivých predikovaných promotorů. Výsledky potvrzují přítomnost sigma-54 závislých promotorů v genomu T. pallidum Nichols. Treponemální faktor sigma-54 je částečně zaměnitelný s escherichiálním faktorem sigma-54, a proto je vhodné experimenty provádět v kmenech rpoN-.

Anotace anglicky

The spirochete T. pallidum ssp. pallidum is the causative agent of syphilis, a sexually transmitted disease characterized by multiple stages and infection of different organs. It was hypothesized that T. pallidum regulates its gene expression during infection of humans. We have studied the function of sigma-54 factor (RpoN) and sigma-54-dependent promoters. Sigma factors inititate transcription by binding to promoter and to RNA-polymerase. The sigma-54-dependent promoters were identified by the PromScan software. pCS26 plasmid was used for the construction of the transcriptional fusions between the promoters and luxCDABE genes. This reporter system was used for verification of identified promoters. The promoters of polA and tpF1 genes were shown to be dependent on overexpression of treponemal rpoN and fhlA both in wild type E. coli and, more extensively, in E. coli rpoN- or E. coli fhlA-. Regulation of polA and tpF1 genes was confirmed using Q-PCR technique.

Návaznosti

• GA310/04/0021, projekt VaV: Název: Postgenomické studie syfilitické spirochety Treponema pallidum

Investor: Grantová agentura ČR, Postgenomické studie syfilitické spirochety Treponema pallidum

• MSM0021622415, záměr: Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

• NR8967, projekt VaV: Název: Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů

Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů