Bioinformatic and image analyses of the cellular localization of the apoptotic proteins endonuclease G, AIF, and AMID during apoptosis in human cells

VAŘECHA, Miroslav, Jana AMRICHOVÁ, Michal ZIMMERMANN, Vladimír ULMAN, Emilie LUKÁŠOVÁ a Michal KOZUBEK. Bioinformatic and image analyses of the cellular localization of the apoptotic proteins endonuclease G, AIF, and AMID during apoptosis in human cells. Apoptosis. USA: Springer Science, 2007, roč. 12, č. 7, s. 1155-1171. ISSN 1360-8185.

Základní údaje

Originální název

Bioinformatic and image analyses of the cellular localization of the apoptotic proteins endonuclease G, AIF, and AMID during apoptosis in human cells

Název česky

Bioinformatická a obrazová analýza buněčné lokalizace apoptotických proteinů endonukleázy G, AIF a AMIDu během apoptózy v lidských buňkách

Autoři

VAŘECHA, Miroslav (203 Česká republika, garant, domácí), Jana AMRICHOVÁ (203 Česká republika, domácí), Michal ZIMMERMANN (203 Česká republika, domácí), Vladimír ULMAN (203 Česká republika, domácí), Emilie LUKÁŠOVÁ (203 Česká republika) a Michal KOZUBEK (203 Česká republika, domácí)

Vydání

Apoptosis, USA, Springer Science, 2007, 1360-8185

---

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Spojené státy

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 3.043

Kód RIV

RIV/00216224:14330/07:00020060

Organizační jednotka

Fakulta informatiky

UT WoS

000247184000003

Klíčová slova anglicky

apoptosis-inducing factor; endonuclease G; AIF-homologous mitochondrion-associated inducer of death; living cells; colocalization image analysis; analysis of amino acid sequence

Štítky

apoptosis-inducing factor, CBIA, cbia-web, colocalization image analysis, endonuclease G, living cells

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno

---

Anotace

V originále

We studied the cellular localization of the apoptotic proteins endonuclease G, AIF, and AMID in silico using three prediction tools and in living cells using both single-cell colocalization image analysis and nuclear translocation analysis. We confirmed the mitochondrial localization of endonuclease G and AIF by prediction analysis and by single-cell colocalization image analysis. We found the AMID protein to be cytoplasmic, most probably incorporated into the cytoplasmic side of the membranes of various organelles. The highest concentration of AMID was observed associated with the Golgi. Colocalization of AMID with lysosomes was also indirectly confirmed by analysis of AMID-rich vesicle velocity using manual tracking analysis. Bioinformatic analysis also detected nuclear localization signals in endonuclease G and AIF, but not in AMID. A novel analysis of time-lapse fluorescence image data during staurosporine-induced apoptosis revealed nuclear translocation only for endonuclease G and AIF.

Česky

Bioinformatická a obrazová analýza buněčné lokalizace apoptotických proteinů endonukleázy G, AIF a AMIDu během apoptózy v lidských buňkách

---

Návaznosti

GA202/04/0907, projekt VaV	Název: Cytometrie s vysokým rozlišením na živých buňkách Investor: Grantová agentura ČR, Cytometrie s vysokým rozlišením na živých buňkách
GP204/03/D031, projekt VaV	Název: Apoptózu vyvolávající faktor (AIF): Jeho uvolnění z mitochondrie a změny, které vyvolává ve struktuře jaderného chromatinu Investor: Grantová agentura ČR, Apoptózu vyvolávající faktor (AIF): Jeho uvolnění z mitochondrie a změny, které vyvolává ve struktuře jaderného chromatinu
GP204/05/P090, projekt VaV	Název: Topografická a funkční charakteristika telomer v různých typech nádorových buněk stanovená in situ a in vivo Investor: Grantová agentura ČR, Topografická a funkční charakteristika telomer v různých typech nádorových buněk stanovená in situ a in vivo
LC535, projekt VaV	Název: Dynamika a organizace chromosomů během buněčného cyklu v normě a patologii Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Dynamika a organizace chromosomů během buněčného cyklu v normě a patologii
MSM0021622419, záměr	Název: Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy