VAŘECHA, Miroslav, Jana AMRICHOVÁ, Michal ZIMMERMANN, Vladimír ULMAN, Emilie LUKÁŠOVÁ a Michal KOZUBEK. Bioinformatic and image analyses of the cellular localization of the apoptotic proteins endonuclease G, AIF, and AMID during apoptosis in human cells. Apoptosis. USA: Springer Science, 2007, roč. 12, č. 7, s. 1155-1171. ISSN 1360-8185.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Bioinformatic and image analyses of the cellular localization of the apoptotic proteins endonuclease G, AIF, and AMID during apoptosis in human cells
Název česky Bioinformatická a obrazová analýza buněčné lokalizace apoptotických proteinů endonukleázy G, AIF a AMIDu během apoptózy v lidských buňkách
Autoři VAŘECHA, Miroslav (203 Česká republika, garant, domácí), Jana AMRICHOVÁ (203 Česká republika, domácí), Michal ZIMMERMANN (203 Česká republika, domácí), Vladimír ULMAN (203 Česká republika, domácí), Emilie LUKÁŠOVÁ (203 Česká republika) a Michal KOZUBEK (203 Česká republika, domácí).
Vydání Apoptosis, USA, Springer Science, 2007, 1360-8185.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor Genetika a molekulární biologie
Stát vydavatele Spojené státy
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor Impact factor: 3.043
Kód RIV RIV/00216224:14330/07:00020060
Organizační jednotka Fakulta informatiky
UT WoS 000247184000003
Klíčová slova anglicky apoptosis-inducing factor; endonuclease G; AIF-homologous mitochondrion-associated inducer of death; living cells; colocalization image analysis; analysis of amino acid sequence
Štítky apoptosis-inducing factor, CBIA, cbia-web, colocalization image analysis, endonuclease G, living cells
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnil: RNDr. Vladimír Ulman, Ph.D., učo 4203. Změněno: 20. 6. 2012 09:03.
Anotace
We studied the cellular localization of the apoptotic proteins endonuclease G, AIF, and AMID in silico using three prediction tools and in living cells using both single-cell colocalization image analysis and nuclear translocation analysis. We confirmed the mitochondrial localization of endonuclease G and AIF by prediction analysis and by single-cell colocalization image analysis. We found the AMID protein to be cytoplasmic, most probably incorporated into the cytoplasmic side of the membranes of various organelles. The highest concentration of AMID was observed associated with the Golgi. Colocalization of AMID with lysosomes was also indirectly confirmed by analysis of AMID-rich vesicle velocity using manual tracking analysis. Bioinformatic analysis also detected nuclear localization signals in endonuclease G and AIF, but not in AMID. A novel analysis of time-lapse fluorescence image data during staurosporine-induced apoptosis revealed nuclear translocation only for endonuclease G and AIF.
Anotace česky
Bioinformatická a obrazová analýza buněčné lokalizace apoptotických proteinů endonukleázy G, AIF a AMIDu během apoptózy v lidských buňkách
Návaznosti
GA202/04/0907, projekt VaVNázev: Cytometrie s vysokým rozlišením na živých buňkách
Investor: Grantová agentura ČR, Cytometrie s vysokým rozlišením na živých buňkách
GP204/03/D031, projekt VaVNázev: Apoptózu vyvolávající faktor (AIF): Jeho uvolnění z mitochondrie a změny, které vyvolává ve struktuře jaderného chromatinu
Investor: Grantová agentura ČR, Apoptózu vyvolávající faktor (AIF): Jeho uvolnění z mitochondrie a změny, které vyvolává ve struktuře jaderného chromatinu
GP204/05/P090, projekt VaVNázev: Topografická a funkční charakteristika telomer v různých typech nádorových buněk stanovená in situ a in vivo
Investor: Grantová agentura ČR, Topografická a funkční charakteristika telomer v různých typech nádorových buněk stanovená in situ a in vivo
LC535, projekt VaVNázev: Dynamika a organizace chromosomů během buněčného cyklu v normě a patologii
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Dynamika a organizace chromosomů během buněčného cyklu v normě a patologii
MSM0021622419, záměrNázev: Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy
VytisknoutZobrazeno: 27. 5. 2024 21:26