2006
Isolation of polymerase chain reaction-ready bacterial DNA from Lake Baikal sediments by carboxyl-functionalised magnetic polymer microspheres
ŠPANOVÁ, Alena, Bohuslav RITTICH, Igor ŠTYRIAK, Iveta ŠTYRIAKOVÁ, Daniel HORÁK et. al.Základní údaje
Originální název
Isolation of polymerase chain reaction-ready bacterial DNA from Lake Baikal sediments by carboxyl-functionalised magnetic polymer microspheres
Název česky
Izolace DNA v kvalitě vhodné pro PCR ze sedimentů Bajkalského jezera pomocí magnetických pomerních částic funkcionalizovaných karboxylovými skupinami
Autoři
ŠPANOVÁ, Alena (203 Česká republika, garant), Bohuslav RITTICH (203 Česká republika), Igor ŠTYRIAK (703 Slovensko), Iveta ŠTYRIAKOVÁ (703 Slovensko) a Daniel HORÁK (203 Česká republika)
Vydání
Journal of Chromatography A, Amsterdam, Elsevier, 2006, 0021-9673
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Článek v odborném periodiku
Obor
10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele
Nizozemské království
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor
Impact factor: 3.554
Kód RIV
RIV/00216224:14310/06:00016161
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
UT WoS
000241092300014
Klíčová slova anglicky
Magnetic microspheres; P(HEMA-co-EDMA); Lake Baikal sediments; Microbial DNA Magnetic separation; Polymerase chain reaction (PCR)
Štítky
Příznaky
Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 19. 12. 2006 16:50, doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.
V originále
Carboxyl group-containing magnetic nonporous poly(2-hydroxyethyl methacrylate-co-ethylene dimethacrylate) (P(HEMA-co-EDMA)) microspheres were used for the isolation of polymerase chain reaction(PCR)-ready DNA from samples of Baikal sediments. The occurence of false -negative results in PCR caused by the presence of extracelular inhibitors in DNA samples was solved using solid phase reversible DNA immobilisation. PCR-ready DNA was reversibly adsorbed to the microspheres in the presence of 8.0% PEG 6000 and 2.0 M sodium chloride concentrations. The adsorbed DNA was released from the microspheres in a low ioninic strength TE buffer. The quality of isolated DNA was checked by PCR amplification.
Česky
Magnetické neporézní poly(2-hydroxyethyl methakrylát-co-ethylen dimethakrylát) (P(HEMA-co-EDMA)) mikročástice byly použity k izolaci DNA z bajkalských sedimentů v kvalitě vhodné pro PCR. Výskyt falešně negativních výsledků v PCR byl způsoben přítomností extracelulárních inhibitorů ve vzorcích DNA. K jejich odstranění byla použita metoda reversibilní imobilizace DNA. DNA byla reversibilně adsorbována na mikročástice v přítomnosti 8,0% PEG 6000 a 2,0 m NaCl. Adsorbovaná DNA byla eluována TE pufrem o nízké iontové síle. Kvalita izolované DNA byla ověřována pomocí PCR.
Návaznosti
| GA203/05/2256, projekt VaV |
|