ŠPANOVÁ, Alena, Bohuslav RITTICH, Igor ŠTYRIAK, Iveta ŠTYRIAKOVÁ a Daniel HORÁK. Isolation of polymerase chain reaction-ready bacterial DNA from Lake Baikal sediments by carboxyl-functionalised magnetic polymer microspheres. Journal of Chromatography A. Amsterdam: Elsevier, 2006, roč. 1130, č. 1, s. 115-121. ISSN 0021-9673.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Isolation of polymerase chain reaction-ready bacterial DNA from Lake Baikal sediments by carboxyl-functionalised magnetic polymer microspheres
Název česky Izolace DNA v kvalitě vhodné pro PCR ze sedimentů Bajkalského jezera pomocí magnetických pomerních částic funkcionalizovaných karboxylovými skupinami
Autoři ŠPANOVÁ, Alena (203 Česká republika, garant), Bohuslav RITTICH (203 Česká republika), Igor ŠTYRIAK (703 Slovensko), Iveta ŠTYRIAKOVÁ (703 Slovensko) a Daniel HORÁK (203 Česká republika).
Vydání Journal of Chromatography A, Amsterdam, Elsevier, 2006, 0021-9673.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Nizozemské království
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor Impact factor: 3.554
Kód RIV RIV/00216224:14310/06:00016161
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
UT WoS 000241092300014
Klíčová slova anglicky Magnetic microspheres; P(HEMA-co-EDMA); Lake Baikal sediments; Microbial DNA Magnetic separation; Polymerase chain reaction (PCR)
Štítky Lake Baikal sediments, Magnetic microspheres, Microbial DNA Magnetic separation, P(HEMA-co-EDMA), Polymerase chain reaction (PCR)
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnil: doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc., učo 1639. Změněno: 19. 12. 2006 16:50.
Anotace
Carboxyl group-containing magnetic nonporous poly(2-hydroxyethyl methacrylate-co-ethylene dimethacrylate) (P(HEMA-co-EDMA)) microspheres were used for the isolation of polymerase chain reaction(PCR)-ready DNA from samples of Baikal sediments. The occurence of false -negative results in PCR caused by the presence of extracelular inhibitors in DNA samples was solved using solid phase reversible DNA immobilisation. PCR-ready DNA was reversibly adsorbed to the microspheres in the presence of 8.0% PEG 6000 and 2.0 M sodium chloride concentrations. The adsorbed DNA was released from the microspheres in a low ioninic strength TE buffer. The quality of isolated DNA was checked by PCR amplification.
Anotace česky
Magnetické neporézní poly(2-hydroxyethyl methakrylát-co-ethylen dimethakrylát) (P(HEMA-co-EDMA)) mikročástice byly použity k izolaci DNA z bajkalských sedimentů v kvalitě vhodné pro PCR. Výskyt falešně negativních výsledků v PCR byl způsoben přítomností extracelulárních inhibitorů ve vzorcích DNA. K jejich odstranění byla použita metoda reversibilní imobilizace DNA. DNA byla reversibilně adsorbována na mikročástice v přítomnosti 8,0% PEG 6000 a 2,0 m NaCl. Adsorbovaná DNA byla eluována TE pufrem o nízké iontové síle. Kvalita izolované DNA byla ověřována pomocí PCR.
Návaznosti
GA203/05/2256, projekt VaVNázev: Magnetické hydrofilní polymerní mikročástice reagující na vnější stimuly pro lékařství a bioinženýrství
Investor: Grantová agentura ČR, Magnetické hydrofilní polymerní mikročástice reagující na vnější stimuly pro lékařství a bioinženýrství
VytisknoutZobrazeno: 12. 10. 2024 17:09