2006
Comparative study on the identification of Bifidobacterium strains using DNA fingerprinting methods
RITTICH, Bohuslav, Jana KŘÍŽOVÁ a Alena ŠPANOVÁZákladní údaje
Originální název
Comparative study on the identification of Bifidobacterium strains using DNA fingerprinting methods
Název česky
Srovnávací studie identifikace bifidobakterií s využitím DNA typizačních metod
Autoři
RITTICH, Bohuslav (203 Česká republika, garant), Jana KŘÍŽOVÁ (203 Česká republika) a Alena ŠPANOVÁ (203 Česká republika)
Vydání
Praha, 5th Meeting of the European Mucosal Immunology Group, od s. 126-126, 1 s. 2006
Nakladatel
Czech Immunological Society
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Stať ve sborníku
Obor
Genetika a molekulární biologie
Stát vydavatele
Česká republika
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Kód RIV
RIV/00216224:14310/06:00018075
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
Klíčová slova anglicky
Bifidobacterium; identification; ARDRA; rep-PCR
Štítky
Příznaky
Mezinárodní význam
Změněno: 2. 1. 2007 16:04, doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.
V originále
Methods based on genus-specific PCR, species-specific PCR, amplified ribosomal DNA restriction analysis (ARDRA) of PCR amplicons (914 bp) using 6 restriction enzymes, DNA fingerprinting methods - RAPD with 7 random primers and rep-PCR using both BOXA1R and (GTG)5 ones, were used to differentiate among 16 type and collection Bifidobacterium strains of 11 species of human origin, B. animalis and B. lactis and Bifidobacterium spp. collected in Culture Collection of Dairy Microorganisms (CCDM, Tábor, Czech Republic). The highest discrimination power had the RAPD method which distinguished all tested species. Bifidobacterium sp. CCDM 223 strain was identified as Bifidobacterium adolescentis species. The other six Bifidobacterium sp. CCDM were classified as species.
Česky
Metody založené na rodově a druhově specifické PCR, restrikční analýze (ARDRA) PCR amplikonu (914 bp) s použitím 6 restrikčních endonukleáz, RAPD s použitím 7 náhodných primerů, rep-PCR s použitím BOXA1R a (GTG)5 primerů byly použity k k rozlišení 16 typových a sbírkových kmenů bifidobakterií náležejících do 11 druhů lidského původu, B. animalis a B. lactis. Nejvyšší rozlišovací schopnost měla metoda RAPD, pomocí které byly rozlišeny všechny analyzované kmeny. Dále byly analyzovány kmeny ze sbírky Laktoflora (CCDM, Tábor, Czech Republic).Kmen Bifidobacterium sp. CCDM 223 byl identifikován jako Bifidobacterium adolescentis.Dalších šest kmenů bylo určeno jako Bifidobacterium lactis.
Návaznosti
| MSM0021622415, záměr |
| ||
| 1G58097, projekt VaV |
|