Comparative study on the identification of Bifidobacterium strains using DNA fingerprinting methods

RITTICH, Bohuslav, Jana KŘÍŽOVÁ a Alena ŠPANOVÁ. Comparative study on the identification of Bifidobacterium strains using DNA fingerprinting methods. In 5th Meeting of the European Mucosal Immunology Group. Praha: Czech Immunological Society, 2006, s. 126-126.

Základní údaje

• Originální název: Comparative study on the identification of Bifidobacterium strains using DNA fingerprinting methods
• Název česky: Srovnávací studie identifikace bifidobakterií s využitím DNA typizačních metod
• Autoři: RITTICH, Bohuslav (203 Česká republika, garant), Jana KŘÍŽOVÁ (203 Česká republika) a Alena ŠPANOVÁ (203 Česká republika).
• Vydání: Praha, 5th Meeting of the European Mucosal Immunology Group, od s. 126-126, 1 s. 2006.
• Nakladatel: Czech Immunological Society

Další údaje

• Originální jazyk: angličtina
• Typ výsledku: Stať ve sborníku
• Obor: Genetika a molekulární biologie
• Stát vydavatele: Česká republika
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• Kód RIV: RIV/00216224:14310/06:00018075
• Organizační jednotka: Přírodovědecká fakulta
• Klíčová slova anglicky: Bifidobacterium; identification; ARDRA; rep-PCR
• Štítky: ARDRA, Bifidobacterium, identification, rep-PCR
• Příznaky: Mezinárodní význam

Anotace

Methods based on genus-specific PCR, species-specific PCR, amplified ribosomal DNA restriction analysis (ARDRA) of PCR amplicons (914 bp) using 6 restriction enzymes, DNA fingerprinting methods - RAPD with 7 random primers and rep-PCR using both BOXA1R and (GTG)5 ones, were used to differentiate among 16 type and collection Bifidobacterium strains of 11 species of human origin, B. animalis and B. lactis and Bifidobacterium spp. collected in Culture Collection of Dairy Microorganisms (CCDM, Tábor, Czech Republic). The highest discrimination power had the RAPD method which distinguished all tested species. Bifidobacterium sp. CCDM 223 strain was identified as Bifidobacterium adolescentis species. The other six Bifidobacterium sp. CCDM were classified as species.

Anotace česky

Metody založené na rodově a druhově specifické PCR, restrikční analýze (ARDRA) PCR amplikonu (914 bp) s použitím 6 restrikčních endonukleáz, RAPD s použitím 7 náhodných primerů, rep-PCR s použitím BOXA1R a (GTG)5 primerů byly použity k k rozlišení 16 typových a sbírkových kmenů bifidobakterií náležejících do 11 druhů lidského původu, B. animalis a B. lactis. Nejvyšší rozlišovací schopnost měla metoda RAPD, pomocí které byly rozlišeny všechny analyzované kmeny. Dále byly analyzovány kmeny ze sbírky Laktoflora (CCDM, Tábor, Czech Republic).Kmen Bifidobacterium sp. CCDM 223 byl identifikován jako Bifidobacterium adolescentis.Dalších šest kmenů bylo určeno jako Bifidobacterium lactis.

Návaznosti

• MSM0021622415, záměr: Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

• 1G58097, projekt VaV: Název: Molekulárně-genetické metody pro identifikaci probiotických bakterií lidského původu s vhodnými technologickými a hygienicko-zdravotními vlastnostmi pro výrobu funkčních potravin.

Investor: Ministerstvo zemědělství ČR, Molekulárně-genetické metody pro identifikaci probiotických bakterií lidského původu s vhodnými technologickými a hygienicko-zdravotními vlastnostmi pro výrobu funkčních potravin