2006
In situ hybridization for mRNA detection in Arabidopsis tissue sections.
HEJÁTKO, Jan, P. BREWER, M. HEISLER, Jiří FRIML, Eva BENKOVÁ et. al.Základní údaje
Originální název
In situ hybridization for mRNA detection in Arabidopsis tissue sections.
Název česky
In situ hybridizace pro detekci mRNA na pletivových řezech Arabidopsis.
Autoři
HEJÁTKO, Jan (203 Česká republika, garant), P. BREWER (36 Austrálie), M. HEISLER (276 Německo), Jiří FRIML (203 Česká republika) a Eva BENKOVÁ (703 Slovensko)
Vydání
Nature Protocols, U.S.A. Nature Publishing Group, 2006, 1745-2473
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Článek v odborném periodiku
Obor
Genetika a molekulární biologie
Stát vydavatele
Spojené státy
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor
Impact factor: 12.040
Kód RIV
RIV/00216224:14310/06:00018084
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
UT WoS
000251155400049
Klíčová slova anglicky
in situ mRNA localization; tissue sections; plants
Příznaky
Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 9. 4. 2010 16:04, doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D.
V originále
Plant biology is currently confronted with an overflow of expression profile data provided by high-throughput microarray transcription analyses. However, the tissue and cellular resolution of these techniques is limited. Thus, it is still necessary to examine the expression pattern of selected candidate genes at a cellular level. Here we present an in situ mRNA hybridization method that is routinely used in the analysis of gene expression patterns. The protocol is optimized for mRNA localizations in sectioned tissue of Arabidopsis seedlings including embryos, roots, hypocotyls, young primary leaves and flowers. The detailed protocol, recommended controls and troubleshooting are presented along with examples of application. The total time for the process is 10 days.
Česky
In situ lokalizace genů je technika, která umožňuje přesnou lokalizaci transkripční aktivity jednotlivých genů na úrovni pletiv i jednotlivých buněk. Zde prezentujeme metodu, kteréá je rutinně využívána v analýze genové exprese a to na řezech z mnoha různých typů pletiv Arabidopsis thaliana, včetně embryí, kořenů, hypokotylů, mladých listů a květů. Je předkládán detailní popis celé metody včetně doporučených kontrol a řešení potenciálních problémů s příklady aplikace protokolu na konkrétní geny. Celkový čas nutný k provedení metody je 10 dní.
Návaznosti
| LC06034, projekt VaV |
| ||
| MSM0021622415, záměr |
|