Conformational Dependence of 31P Chemical Shift Tensors in Nucleic Acids

PRECECHTELOVA, Jana, Markéta MUNZAROVÁ a Vladimír SKLENÁŘ. Conformational Dependence of 31P Chemical Shift Tensors in Nucleic Acids. In Viral RNA: Structure, Function and Targeting. Heidelberg: EMBL Heidelberg, 2007, s. 8-8.

Základní údaje

• Originální název: Conformational Dependence of 31P Chemical Shift Tensors in Nucleic Acids
• Název česky: Konformacni zavislost tenzoru 31P chemickeho posunu v nukleovych kyselinach
• Autoři: PRECECHTELOVA, Jana, Markéta MUNZAROVÁ a Vladimír SKLENÁŘ.
• Vydání: Heidelberg, Viral RNA: Structure, Function and Targeting, od s. 8-8, 1 s. 2007.
• Nakladatel: EMBL Heidelberg

Další údaje

• Originální jazyk: angličtina
• Typ výsledku: Konferenční abstrakt
• Obor: 10403 Physical chemistry
• Stát vydavatele: Česká republika
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• Organizační jednotka: Přírodovědecká fakulta
• Klíčová slova anglicky: RNA; Structure; Function
• Štítky: Function, RNA, structure
• Příznaky: Mezinárodní význam

Anotace

NMR parameters of the phosphorus atom in nucleic acids were subject of theoretical investigations in late 70s and 80s using semi-empirical or ab-initio CHF approach. The complexity of studied systems and results were limited by the computational power and theoretical background available at the time. We will describe a detailed of the conformational dependence of 31P chemical shift tensors in RNA and DNA using up-to-date methodology. For the first time, the orientation of the phosphorus chemical shift tensors in all canonical and several non-canonical of the RNa and DNA sugar-phosphate backbone is investigated in detail as a function of torsion angles and solvent interactions. Several models are inspected with respect to their size and the patterns of the hydration shell. The results are compared to experimental data.

Anotace česky

NMR parameters of the phosphorus atom in nucleic acids were subject of theoretical investigations in late 70s and 80s using semi-empirical or ab-initio CHF approach. The complexity of studied systems and results were limited by the computational power and theoretical background available at the time. We will describe a detailed of the conformational dependence of 31P chemical shift tensors in RNA and DNA using up-to-date methodology. For the first time, the orientation of the phosphorus chemical shift tensors in all canonical and several non-canonical of the RNa and DNA sugar-phosphate backbone is investigated in detail as a function of torsion angles and solvent interactions. Several models are inspected with respect to their size and the patterns of the hydration shell. The results are compared to experimental data.

Návaznosti

• GD204/03/H016, projekt VaV: Název: Strukturní biofyzika makromolekul

Investor: Grantová agentura ČR, Strukturní biofyzika makromolekul

• LC06030, projekt VaV: Název: Biomolekulární centrum

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Biomolekulární centrum

• MSM0021622413, záměr: Název: Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím