J 2007

Experimental design in intraspecific organelle DNA sequence studies I: haplotype detection methods

STONEBERG HOLT, Sierra Dawn a Petr BUREŠ

Základní údaje

Originální název

Experimental design in intraspecific organelle DNA sequence studies I: haplotype detection methods

Název česky

Experimentální design intraspecifických studií založených na studiu sekvencí organelové DNA I: metody detekce haplotypů

Autoři

STONEBERG HOLT, Sierra Dawn (840 Spojené státy) a Petr BUREŠ (203 Česká republika, garant)

Vydání

Taxon, International Assoc. for Plant Taxonomy, 2007, 0040-0262

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Rakousko

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 2.524

Kód RIV

RIV/00216224:14310/07:00022014

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

UT WoS

000244825300015

Klíčová slova anglicky

chemical cleavage of mismatch (CCM); heteroduplex analysis (HA); intraspecific organelle sequence studies; literature review; phylogeography; single-strand conformation polymorphism (SSCP)

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 25. 6. 2009 11:09, prof. RNDr. Petr Bureš, Ph.D.

Anotace

V originále

Phylogenetic studies of organelle DNA sequences at low taxonomic levels present a researcher with specific experimental design challenges. Such studies require sampling of large numbers of individuals, many of which share identical haplotypes. The process is often limited by time and money required for DNA sequencing. A variety of mutation detection methods has been developed to circumvent this limitation. This paper briefly reviews the available methods and presents some of their advantages and disadvantages. The applicability of these methods to nuclear DNA studies is discussed.

Česky

Přehled metod užívaných k detekci haplotypů

Návaznosti

LC06073, projekt VaV
Název: Centrum pro výzkum biodiverzity
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Centrum pro výzkum biodiverzity
MSM0021622416, záměr
Název: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Diverzita biotických společenstev: kauzální analýza variability v prostoru a čase