J 2007

Isolation and characterization of microsatellites in Leuciscus cephalus (Cypriniformes, Cyprinidae) and cross-species amplification within the family Cyprinidae.

VYSKOČILOVÁ, Martina, Andrea ŠIMKOVÁ a Jean-François MARTIN

Základní údaje

Originální název

Isolation and characterization of microsatellites in Leuciscus cephalus (Cypriniformes, Cyprinidae) and cross-species amplification within the family Cyprinidae.

Název česky

Izolace a charakterizace nových mikrosatelitů u Leuciscus cephalus (Cypriniformes, Cyprinidae) a cross-species amplifikace v čeledi Cyprinidae.

Autoři

VYSKOČILOVÁ, Martina (203 Česká republika, garant, domácí), Andrea ŠIMKOVÁ (703 Slovensko, domácí) a Jean-François MARTIN (250 Francie)

Vydání

Molecular Ecology Notes, Blackwell Publishing, 2007, 1471-8278

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 1.257

Kód RIV

RIV/00216224:14310/07:00020260

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

UT WoS

000250647700065

Klíčová slova anglicky

Leuciscus; Cyprinidae; microsatellites; primers; cross-amplification

Štítky

Anotace

ORIG CZ

V originále

Thirteen polymorphic microsatellites were isolated from Leuciscus cephalus, a widespread cyprinid species with great ecological tolerance. Together with the cross-species amplification of six additional loci originally published for three cyprinid fish species, we optimized a multiplex panel for L. cephalus allowing the genotyping of 19 polymorphic loci. Number of alleles and heterozygosity per locus in a sample of 20 fish individuals ranged from two to sixteen and from 0.05 to 0.90, respectively. These primers will be useful in determining the population structure of L. cephalus. In addition, successful cross-amplification was obtained for several species of Cyprinidae.

Česky

Pro Leuciscus cephalus bylo izolováno a charakterizováno 13 polymorfních mikrosatelitů, úspěšně bylo testováno 6 mikrosatelitových markerů původně popsaných pro jiné druhy z čeledi Cyprinidae. Dále bylo všech 19 mikrosatelitů použito pro cross-species amplifikaci u několika daších druhů ryb z čeledi Cyprinidae.

Návaznosti

GA524/04/1128, projekt VaV
Název: MHC třída IIB genů evropských kaprovitých ryb: jejich genetická variabilita a evoluce ve vztahu k životní strategii hostitelů a parazitismu
Investor: Grantová agentura ČR, MHC třída IIB genů evropských kaprovitých ryb: jejich genetická variabilita a evoluce ve vztahu k životní strategii hostitelů a parazitismu
LC522, projekt VaV
Název: ICHTYOPARAZITOLOGIE - centrum základního výzkumu
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Ichtyoparazitologie - centrum základního výzkumu
MSM0021622416, záměr
Název: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Diverzita biotických společenstev: kauzální analýza variability v prostoru a čase