D 2007

Comparative genomics of closely related treponemal strains

STROUHAL, Michal, Petra MATĚJKOVÁ, David ŠMAJS, E. SODERGREN, S. J. NORRIS et. al.

Základní údaje

Originální název

Comparative genomics of closely related treponemal strains

Název česky

Komparativní genomika příbuzných treponemálních kmenů

Autoři

STROUHAL, Michal, Petra MATĚJKOVÁ, David ŠMAJS, E. SODERGREN, S. J. NORRIS a G. M. WEINSTOCK

Vydání

Munich, Germany, In Abstract Book: 17th European Congress of Clinical Microbiology and Infectous Diseases, INTERNATIONAL JOURNAL OF ANTIMICROBIAL AGENTS, s. 915-915, 2007

Nakladatel

European Congress of Clinical Microbiology and Infectous Diseases

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 2.338

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

ISSN

UT WoS

000253692400751

Klíčová slova anglicky

Comparative genomics; treponemal strains

Štítky

Změněno: 8. 4. 2010 14:46, prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D.

Anotace

ORIG CZ

V originále

Genus Treponema includes several pathogenic spirochetes: Treponema pallidum ssp. pallidum (TPA) is the causative agent of sexually transmitted syphilis, Treponema pallidum ssp. pertenue (TPE) causes endemic nonveneral treponemal infections and T. paraluiscuniculi (TPAR) is the etiologic agent of veneral syphilis in rabbits and does not infect humans. These treponemes cannot be continuously cultivated under in vitro conditions and are indistinguishable by morphological and serological methods. In this study, genomes of closely related treponemes were compared. When compared to the Nichols genome the prominent indels and sequence changes were preferentially localised in tpr genes (and in the hypothetical genes in the vicinity of tpr genes). Differences in number of tandem repetitions within the gene TP470 and genes TP0433-4 (hypothetical genes) were detected in all analysed strains. In the second case fusion of both genes (TP0433-4) resulted in one acidic repeat protein gene (arp gene).

Česky

Metoda whole genome fingerprinting (WGF) byla použita pro srovnání genomů kmenů Treponema pallidum ssp. pallidum Nichols, SS14 (TPA), Treponema pallidum ssp. pertenue Samoa D (TPE) a Treponema paraluiscuniculi Cuniculi A (TPAR).

Návaznosti

GA310/07/0321, projekt VaV
Název: Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum
Investor: Grantová agentura ČR, Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum
MSM0021622415, záměr
Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
NR8967, projekt VaV
Název: Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů