Genetické rozdíly mezi původci yaws a syfilis.

D 2007

Genetické rozdíly mezi původci yaws a syfilis.

STROUHAL, Michal, David ŠMAJS and Petra MATĚJKOVÁ

Basic information

Original name

Genetické rozdíly mezi původci yaws a syfilis.

Name in Czech

Genetické rozdíly mezi původci yaws a syfilis.

Name (in English)

Genetic differences between causative agents of yaws and syfilis.

Authors

STROUHAL, Michal, David ŠMAJS and Petra MATĚJKOVÁ

Edition

Brno, XI. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků, p. 13-14, 2 pp. 2007

Publisher

Masarykova univerzita v Brně

Other information

Language

Czech

Type of outcome

Stať ve sborníku

Field of Study

Genetics and molecular biology

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

Organization unit

Faculty of Medicine

ISBN

978-80-210-4234-6

Keywords in English

Genetic differences; yaws; syfilis

Abstract

ORIG EN

V originále

Rod Treponema zahrnuje několik patogenních spirochet: T. pallidum ssp. pallidum (TPA) je původcem sexuálně přenosného onemocnění syfilis, T. pallidum ssp. pertenue (TPE) vyvolává endemické nevenerální treponemální infekce a T. paraluiscuniculi (TPAR) způsobuje venerickou spirochetózu králíků a není patogenní pro člověka. V této studii byly porovnány genomy blízce příbuzných treponemálních kmenů Nichols (TPA), SS14 (TPA), Samoa D (TPE) a Cuniculi A (TPAR) pomocí metody whole genome fingerprinting (WGF) a komparativního genomového sekvenování (CGS). U WGF byly genomy studovaných kmenů rozděleny do 97 překrývajících se intervalů, tyto intervaly byly amplifikovány a štěpeny restrikčními enzymy BamH I, EcoR I a Hind III. Jednotlivé restrikční profily byly použity k identifikaci heterologních oblastí. CGS byla založená na hybridizaci testované genomové DNA kmenů SS14, Samoa D a Cuniculi A k referenční genomové DNA kmene Nichols na oligonukleotidovém čipu. Byly získány kompletní nukleotidové sekvence kmenů SS14 (TPA) a Samoa D (TPE). Sekvenční rozdíly mezi genomy blízce příbuzných treponem zjištěné metodami WGF a CGS byly použity pro definování poddruhové variability T. pallidum a vytipování kandidátních úseků pro screening klinických izolátů.

In English

Genetic differences between causative agents of yaws and syfilis were determined, described and analyzed.

Links

GA310/07/0321, research and development project

Name: Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum

Investor: Czech Science Foundation

MSM0021622415, plan (intention)

Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations

NR8967, research and development project

Name: Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů

Investor: Ministry of Health of the CR

Citovat

STROUHAL, Michal, David ŠMAJS and Petra MATĚJKOVÁ. Genetické rozdíly mezi původci yaws a syfilis. (Genetic differences between causative agents of yaws and syfilis.). In XI. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků. Brno: Masarykova univerzita v Brně, 2007, p. 13-14. ISBN 978-80-210-4234-6.

@inproceedings{720032,
   author = {Strouhal, Michal and Šmajs, David and Matějková, Petra},
   address = {Brno},
   booktitle = {XI. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků},
   keywords = {Genetic differences; yaws; syfilis},
   language = {cze},
   location = {Brno},
   isbn = {978-80-210-4234-6},
   pages = {13-14},
   publisher = {Masarykova univerzita v Brně},
   title = {Genetické rozdíly mezi původci yaws a syfilis.},
   year = {2007}
}

TY  - JOUR
ID  - 720032
AU  - Strouhal, Michal - Šmajs, David - Matějková, Petra
PY  - 2007
TI  - Genetické rozdíly mezi původci yaws a syfilis.
PB  - Masarykova univerzita v Brně
CY  - Brno
SN  - 9788021042346
KW  - Genetic differences
KW  - yaws
KW  - syfilis
N2  - Rod Treponema zahrnuje několik patogenních spirochet: T. pallidum ssp. pallidum (TPA) je původcem sexuálně přenosného onemocnění syfilis, T. pallidum ssp. pertenue (TPE) vyvolává endemické nevenerální treponemální infekce a T. paraluiscuniculi (TPAR) způsobuje venerickou spirochetózu králíků a není patogenní pro člověka. V této studii byly porovnány genomy blízce příbuzných treponemálních kmenů Nichols (TPA), SS14 (TPA), Samoa D (TPE) a Cuniculi A (TPAR) pomocí metody whole genome fingerprinting (WGF) a komparativního genomového sekvenování (CGS). U WGF byly genomy studovaných kmenů rozděleny do 97 překrývajících se intervalů, tyto intervaly byly amplifikovány a štěpeny restrikčními enzymy BamH I, EcoR I a Hind III. Jednotlivé restrikční profily byly použity k identifikaci heterologních oblastí. CGS byla založená na hybridizaci testované genomové DNA kmenů SS14, Samoa D a Cuniculi A k referenční genomové DNA kmene Nichols na oligonukleotidovém čipu. Byly získány kompletní nukleotidové sekvence kmenů SS14 (TPA) a Samoa D (TPE). Sekvenční rozdíly mezi genomy blízce příbuzných treponem zjištěné metodami WGF a CGS byly použity pro definování poddruhové variability T. pallidum a vytipování kandidátních úseků pro screening klinických izolátů.
ER  -

STROUHAL, Michal, David ŠMAJS and Petra MATĚJKOVÁ. Genetické rozdíly mezi původci yaws a syfilis. (Genetic differences between causative agents of yaws and syfilis.). In \textit{XI. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků}. Brno: Masarykova univerzita v Brně, 2007, p.~13-14. ISBN~978-80-210-4234-6.

Detailed Information on Publication Record