2007
Využití metody ARDRA pro druhovou identifikaci nových kmenů bakterií rodu Bifidobacterium
KŠICOVÁ, Kateřina, Alena ŠPANOVÁ a Bohuslav RITTICHZákladní údaje
Originální název
Využití metody ARDRA pro druhovou identifikaci nových kmenů bakterií rodu Bifidobacterium
Název anglicky
The use of ARDRA method for specific identification of new Bifidobacterium strains
Autoři
KŠICOVÁ, Kateřina (203 Česká republika, garant), Alena ŠPANOVÁ (203 Česká republika) a Bohuslav RITTICH (203 Česká republika)
Vydání
Brno, XI. Setkání biochemiků a molekulárních biologů, od s. 64-65, 2 s. 2007
Nakladatel
Masarykova univerzita
Další údaje
Jazyk
čeština
Typ výsledku
Stať ve sborníku
Obor
Genetika a molekulární biologie
Stát vydavatele
Česká republika
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Kód RIV
RIV/00216224:14310/07:00022495
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
ISBN
978-80-210-4234-6
Klíčová slova anglicky
Bifidobacterium; ARDRA; identification
Štítky
Změněno: 24. 10. 2007 15:45, doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.
V originále
Pomocí ARDRA analýzy identifikovat bakteriální kmeny isolované z humánních zdrojů, které byly rodově specifickou PCR zařazeny do rodu Bifidobacterium a které při použití druhově specifických PCR vykazovaly zkřížené reakce a proto nemohly být zařazeny do druhů. Restrikční analýza amplikonu 914bp pomocí restriktáz AluI a Sau3 AI umožnila odlišení druhů B .adolescentis, B. bifidum, B. breve, B. catenulatum, B. infantis a B. longum. Celkem bylo rozlišeno a zařazeno do druhů deset z jedenácti nově isolovaných kmenů. Lze konstatovat, že ARDRA analýza je rychlá a reprodukovatelná identifikační metoda s vysokým diskriminačním potenciálem na úrovni druhu.
Anglicky
ARDRA analysis was used for the identification of 11 selected bacterial strains isolated from human sources. These strains were identified into the genus Bifidobacterium using genus-specific PCR. However they could not be identified into species using species-specific PCR due to the cross reactions. Analysis of genus specific amplicon of 914 bp using restrictases AluI and Sau3AI enabled the differentiation of species B. adolescentis, B. bifidum, B. breve, B. catenulatum, B. infantis and B. longum. Alltogether 10 strains could be identified into species. In conclusion, ARDRA analysis is a quick and reproducible identification procedure with high discrimination potential for individual species.
Návaznosti
| MSM0021622415, záměr |
| ||
| QF3169, projekt VaV |
|