Isolation of PCR-ready DNA from real samples containing PCR inhibitors

ŠPANOVÁ, Alena, Bohuslav RITTICH, Daniel HORÁK a Alois RYBNIKÁŘ. Isolation of PCR-ready DNA from real samples containing PCR inhibitors. In Biopowders; Advances in the Powder Technology. Budapest, Hungary: Research Institute of Chemical and Process Enginnering, University of Pannonia, Vesazprém, Hungary, 2007, s. 159-164. ISBN 978-963-9696-23-5.

Základní údaje

• Originální název: Isolation of PCR-ready DNA from real samples containing PCR inhibitors
• Název česky: Izolace DNA v kvalitě pro PCR ze vzorků obsahujících inhibitory PCR
• Autoři: ŠPANOVÁ, Alena (203 Česká republika, garant), Bohuslav RITTICH (203 Česká republika), Daniel HORÁK (203 Česká republika) a Alois RYBNIKÁŘ (203 Česká republika).
• Vydání: Budapest, Hungary, Biopowders; Advances in the Powder Technology, od s. 159-164, 6 s. 2007.
• Nakladatel: Research Institute of Chemical and Process Enginnering, University of Pannonia, Vesazprém, Hungary

Další údaje

• Originální jazyk: angličtina
• Typ výsledku: Stať ve sborníku
• Obor: Genetika a molekulární biologie
• Stát vydavatele: Maďarsko
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• Kód RIV: RIV/00216224:14310/07:00020502
• Organizační jednotka: Přírodovědecká fakulta
• ISBN: 978-963-9696-23-5
• Klíčová slova anglicky: fungi; Trichophyton; nonporous magnetic hydrophilic microspheres; P(HEMA-co-EDMA); P(HEMA-co-GMA)
• Štítky: fungi, nonporous magnetic hydrophilic microspheres, P(HEMA-co-EDMA), P(HEMA-co-GMA), Trichophyton
• Příznaky: Mezinárodní význam, Recenzováno

Anotace

Hydrophilic magnetic particles coated by carboxyl groups were used for PCR-ready DNA isolation. DNA was adsorbed on magnetic particles in the presence of 8 wt. % of poly(ethylene glycol) (PEG 6,000) and 2 M NaCl concentrations, washed and eluted into TE buffer (10 mM Tris-HCl, pH 7.8; 1 mM EDTA; pH 8.0). The eluted DNA was used directly for PCR amplification and identification of Lactobacillus and Bifidobacterium cells in dairy products (cheese, fermented dairy products) and lyophilisates, Trichophyton cells in mixed cultures and bacterial cells in sediments from Lake Baikal. It was also used in GMO testing in foods with success.

Anotace česky

Hydrofilní magnetickémikročástice skarboxylovými skupinami byla použity k izolaciDna v kvalitě vhodné pro PCR. DNA byla adsorbována na magnetické částice v přítomnosti 8 % (váh) poly(ethylen glykolu) (PEG 6000) and 2 M NaCl promyta a elutována TE pufrem (10 mM Tris-HCl, pH 7,8; 1 mM EDTA; pH 8,0). Eluovaná DNA byla přímo použita v PCR amplifikaci a identification buněk Lactobacillus a Bifidobacterium v mléčných výrobcích (sýry, kysané mléčné výrobky) a lyofilizátů buněk Trichophyton cells ve směsných kulturách a bakteriálních buněk v sedimentech jezera Bajkal. postup byl rovněž s úspěchem použit při identifikaci GMO v potravinách.

Návaznosti

• GA203/05/2256, projekt VaV: Název: Magnetické hydrofilní polymerní mikročástice reagující na vnější stimuly pro lékařství a bioinženýrství

Investor: Grantová agentura ČR, Magnetické hydrofilní polymerní mikročástice reagující na vnější stimuly pro lékařství a bioinženýrství

• MSM0021622415, záměr: Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

• 1G57037, projekt VaV: Název: Aplikace molekulárně biologických metod pro efektivní využití genetických zdrojů BMK a pro charakterizaci kvality funkčních potravin.

Investor: Ministerstvo zemědělství ČR, Aplikace molekulárně biologických metod pro efektivní využití genetických zdrojů BMK a pro charakterizaci kvality funkčních potravin