Isolation of PCR-ready DNA from real samples containing PCR inhibitors

ŠPANOVÁ, Alena, Bohuslav RITTICH, Daniel HORÁK a Alois RYBNIKÁŘ. Isolation of PCR-ready DNA from real samples containing PCR inhibitors. In Biopowders; Advances in the Powder Technology. Budapest, Hungary: Research Institute of Chemical and Process Enginnering, University of Pannonia, Vesazprém, Hungary, 2007, s. 159-164. ISBN 978-963-9696-23-5.

Základní údaje

Originální název

Isolation of PCR-ready DNA from real samples containing PCR inhibitors

Název česky

Izolace DNA v kvalitě pro PCR ze vzorků obsahujících inhibitory PCR

Autoři

ŠPANOVÁ, Alena (203 Česká republika, garant), Bohuslav RITTICH (203 Česká republika), Daniel HORÁK (203 Česká republika) a Alois RYBNIKÁŘ (203 Česká republika)

Vydání

Budapest, Hungary, Biopowders; Advances in the Powder Technology, od s. 159-164, 6 s. 2007

Nakladatel

Research Institute of Chemical and Process Enginnering, University of Pannonia, Vesazprém, Hungary

---

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Maďarsko

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Kód RIV

RIV/00216224:14310/07:00020502

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

ISBN

978-963-9696-23-5

Klíčová slova anglicky

fungi; Trichophyton; nonporous magnetic hydrophilic microspheres; P(HEMA-co-EDMA); P(HEMA-co-GMA)

Štítky

fungi, nonporous magnetic hydrophilic microspheres, P(HEMA-co-EDMA), P(HEMA-co-GMA), Trichophyton

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno

---

Anotace

V originále

Hydrophilic magnetic particles coated by carboxyl groups were used for PCR-ready DNA isolation. DNA was adsorbed on magnetic particles in the presence of 8 wt. % of poly(ethylene glycol) (PEG 6,000) and 2 M NaCl concentrations, washed and eluted into TE buffer (10 mM Tris-HCl, pH 7.8; 1 mM EDTA; pH 8.0). The eluted DNA was used directly for PCR amplification and identification of Lactobacillus and Bifidobacterium cells in dairy products (cheese, fermented dairy products) and lyophilisates, Trichophyton cells in mixed cultures and bacterial cells in sediments from Lake Baikal. It was also used in GMO testing in foods with success.

Česky

Hydrofilní magnetickémikročástice skarboxylovými skupinami byla použity k izolaciDna v kvalitě vhodné pro PCR. DNA byla adsorbována na magnetické částice v přítomnosti 8 % (váh) poly(ethylen glykolu) (PEG 6000) and 2 M NaCl promyta a elutována TE pufrem (10 mM Tris-HCl, pH 7,8; 1 mM EDTA; pH 8,0). Eluovaná DNA byla přímo použita v PCR amplifikaci a identification buněk Lactobacillus a Bifidobacterium v mléčných výrobcích (sýry, kysané mléčné výrobky) a lyofilizátů buněk Trichophyton cells ve směsných kulturách a bakteriálních buněk v sedimentech jezera Bajkal. postup byl rovněž s úspěchem použit při identifikaci GMO v potravinách.

---

Návaznosti

GA203/05/2256, projekt VaV	Název: Magnetické hydrofilní polymerní mikročástice reagující na vnější stimuly pro lékařství a bioinženýrství Investor: Grantová agentura ČR, Magnetické hydrofilní polymerní mikročástice reagující na vnější stimuly pro lékařství a bioinženýrství
MSM0021622415, záměr	Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
1G57037, projekt VaV	Název: Aplikace molekulárně biologických metod pro efektivní využití genetických zdrojů BMK a pro charakterizaci kvality funkčních potravin. Investor: Ministerstvo zemědělství ČR, Aplikace molekulárně biologických metod pro efektivní využití genetických zdrojů BMK a pro charakterizaci kvality funkčních potravin