J 2007

Ancestral Chromosomal Blocks Are Triplicated in Brassiceae Species with Varying Chromosome Number and Genome Size

LYSÁK, Martin, Kwok CHEUNG, Michaela KITSCHKE a Petr BUREŠ

Základní údaje

Originální název

Ancestral Chromosomal Blocks Are Triplicated in Brassiceae Species with Varying Chromosome Number and Genome Size

Název česky

Ancestral Chromosomal Blocks Are Triplicated in Brassiceae Species with Varying Chromosome Number and Genome Size

Autoři

LYSÁK, Martin (203 Česká republika, garant, domácí), Kwok CHEUNG (826 Velká Británie a Severní Irsko), Michaela KITSCHKE (276 Německo) a Petr BUREŠ (203 Česká republika, domácí)

Vydání

Plant Physiology, USA, American Society of Plant Physiologists, 2007, 0032-0889

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Spojené státy

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Impakt faktor

Impact factor: 6.367

Kód RIV

RIV/00216224:14310/07:00019484

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

UT WoS

000249893600011

Klíčová slova anglicky

chromosomel painting; genome size; chromosomal evolution; paleopolyploidy

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 26. 3. 2019 20:15, prof. RNDr. Petr Bureš, Ph.D.

Anotace

V originále

Comparative painting analysis of block F of the crucifer Ancestral Karyotype (AK; n=8), consisting of 24 conserved genomic blocks, in 10 species traditionally treated as members of the tribe Brassiceae. Three homeologous copies of block F were identified per haploid chromosome complement in Brassiceae with 2n=14, 18, 20, 32, and 36. In high-polyploid Crambe maritima (2n=60), C. cordifolia (2n=120), and Vella pseudocytisus (2n=68), 6, 12, and 6 copies have been revealed, respectively. In subtribe Zillineae, two of the three homeologous regions were combined via a reciprocal translocation onto one chromosome. Altogether, these findings provide compelling evidence of an ancient hexaploidization event and corresponding whole-genome triplication shared by the tribe Brassiceae. Only two homeologous copies of block F suggest a whole-genome duplication but not the triplication event in Orychophragmus violaceus (2n=24), and confirm its phylogenetic position outside the tribe Brassiceae.

Česky

Srovnávací paintingová analýza bloku F ancestrálního brukvovitého karyotypu (n=8), sestávajícího z 24 conzervativních genomických bloků, v 10 druzích tradičně považovaných za příslušné k tribu Brassiceae. 3 homeologní kopie bloku F byly identifikovány v haploidním chromosomovém komplementu u Brassiceae s 2n=14, 18, 20, 32 a 36. U vysoce polyploidních Crambe maritima (2n=60), C. cordifolia (2n=120) a Vella pseudocytisus (2n=68), 6, 12, resp. 6 kopií bylo zaznamenáno. V subtribu Zillineae, 2 ze 3 homeologních regionů se kombinovalo reciprokou translokací v rámci 12 chromosomu. Obecně tyto poznatky potvrzují paleo-hexaploidizaci a korespondují s celogenomovou triplikací v rámci tribu Brassiceae. Pouze dvě homeologní kopie bloku F ukazují na celogenomovou duplikaci a ne triplikaci u Orychophragmus violaceus (2n=24) a potvrzují jeho fylogenetické postavení mimo tribus Brassiceae.

Návaznosti

KJB601630606, projekt VaV
Název: Evoluce karyotypu brukvovitých rostlin (Brassicaceae)
Investor: Akademie věd ČR, Evoluce karyotypu brukvovitých rostlin (Brassicaceae)
LC06073, projekt VaV
Název: Centrum pro výzkum biodiverzity
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Centrum pro výzkum biodiverzity
MSM0021622415, záměr
Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
MSM0021622416, záměr
Název: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Diverzita biotických společenstev: kauzální analýza variability v prostoru a čase