D 2007

TRITON: Graphic software for docking ligands to protein mutants

PROKOP, Martin, Jan ADAM, Zdeněk KŘÍŽ, Michaela WIMMEROVÁ, Jaroslav KOČA et. al.

Základní údaje

Originální název

TRITON: Graphic software for docking ligands to protein mutants

Název česky

TRITON: Graphic software for docking ligands to protein mutants

Autoři

PROKOP, Martin, Jan ADAM, Zdeněk KŘÍŽ, Michaela WIMMEROVÁ a Jaroslav KOČA

Vydání

Prague, Modeling Interactions in Biomolecules III, book of abstracts, s. 44-44, 2007

Nakladatel

Neuveden

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

Klíčová slova anglicky

TRITON; molecular modelling; graphical software; protein-ligand docking

Příznaky

Mezinárodní význam
Změněno: 7. 11. 2007 16:00, Mgr. Martin Prokop, Ph.D.

Anotace

V originále

We developed graphic program TRITON which automates processes related to computational engineering of proteins. Newest version of TRITON (4.0) was extended to enable study of ligand-protein binding using docking methodology. External program AutoDock is used for searching binding modes and calculation of binding energy. Methodology was tested with monosaccharide ligands which were docked into structure of PA-IIL lectin and some of its mutants. Program TRITON is available free for academic users.

Česky

We developed graphic program TRITON which automates processes related to computational engineering of proteins. Newest version of TRITON (4.0) was extended to enable study of ligand-protein binding using docking methodology. External program AutoDock is used for searching binding modes and calculation of binding energy. Methodology was tested with monosaccharide ligands which were docked into structure of PA-IIL lectin and some of its mutants. Program TRITON is available free for academic users.

Návaznosti

MSM0021622413, záměr
Název: Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím