2007
Využití rep-PCR pro identifikaci klinicky významných druhů stafylokoků
NOVÁKOVÁ, DanaZákladní údaje
Originální název
Využití rep-PCR pro identifikaci klinicky významných druhů stafylokoků
Název anglicky
Application of rep-PCR for identification of clinically significant staphylococci
Autoři
NOVÁKOVÁ, Dana (203 Česká republika, garant)
Vydání
Bratislava, XV. Moravsko-Slovenské mikrobiologické dni, s. 15-15, 2007
Nakladatel
Slovenská spoločnost klinickej mikrobiológie
Další údaje
Jazyk
čeština
Typ výsledku
Stať ve sborníku
Obor
10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele
Česká republika
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Kód RIV
RIV/00216224:14310/07:00023041
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
ISSN
Klíčová slova anglicky
rep-PCR; staphylococci
Štítky
Změněno: 10. 12. 2007 14:49, Mgr. Dana Nováková, Ph.D.
V originále
Využití rep-PCR pro identifikaci klinicky významných druhů stafylokoků. Nováková, D. Česká sbírka mikroorganismů, Masarykova univerzita Úvod. Rychlá a spolehlivá identifikace klinických izolátů představujících pro pacienta život ohrožující nebezpečí je stále aktuálnější. Výskyt a závažnost nozokomiálních, ale i běžných infekcí způsobených stafylokoky patří mezi jeden z nejsledovanějších problému dnešní mikrobiologie. Metodika. Zástupci devíti nejčastěji izolovaných a zároveň klinicky nejvýznamnější druhů a poddruhů stafylokoků člověka (S. aureus subsp. aureus, S. hominis subsp. hominis, S. hominis subsp. novobiosepticus, S. haemolyticus, S. saprophyticus subsp. saprophyticus, S. epidermidis, S. lugdunensis, S. warneri a S. simulans) pocházejících z různých typů materiálu byly podrobeny analýze repetitivních sekvencí za použití amplifikace s primery (GTG)5. Výsledky. Sluková analýza prokázala, že všechny druhy zahrnuté do studie tvoří druhově specifické, dobře odlišitelné rep-(GTG)5 profily. Nejvíce homogenní profily byly zjištěny u kmenů Staphylococcus lugdunensis (téměř 89%) a dále u kmenů Staphylococcus epidermidis (asi 70%). Nejvíce heterogenní profily byly naopak prokázány u kmenů Staphylococcus aureus subsp. aureus (kolem 40%). Shluková analýza zahrnující zástupce všech validně popsaných stafylokoků, však ukázala, že i přes poměrně nízkou podobnost profilů těchto izolátů, jsou tyto jasně odlišitelné od profilů ostatních taxonů. Dvojice poddruhů S. hominis subsp. hominis, S. hominis subsp. novobiosepticus a S. saprophyticus subsp. saprophyticus a typový kmen S. saprophyticus subsp. bovis netvořily poddruhově specifické profily a náležely do společných shluků. Závěr. Studie jasně prokázala vhodnost rep-(GTG)5 PCR pro rychlou a spolehlivou druhovou identifikaci klinicky významných stafylokoků. Práce byla částečně podpořena projektem MSM0021622416.
Anglicky
Application of rep-PCR for identification of staphylococci
Návaznosti
| MSM0021622416, záměr |
|