NOVÁKOVÁ, Dana. Využití rep-PCR pro identifikaci klinicky významných druhů stafylokoků (Application of rep-PCR for identification of clinically significant staphylococci). In XV. Moravsko-Slovenské mikrobiologické dni. Bratislava: Slovenská spoločnost klinickej mikrobiológie, 2007, p. 15. ISSN 1335-8219.
Other formats:   BibTeX LaTeX RIS
Basic information
Original name Využití rep-PCR pro identifikaci klinicky významných druhů stafylokoků
Name (in English) Application of rep-PCR for identification of clinically significant staphylococci
Authors NOVÁKOVÁ, Dana (203 Czech Republic, guarantor).
Edition Bratislava, XV. Moravsko-Slovenské mikrobiologické dni, p. 15-15, 2007.
Publisher Slovenská spoločnost klinickej mikrobiológie
Other information
Original language Czech
Type of outcome Proceedings paper
Field of Study 10600 1.6 Biological sciences
Country of publisher Czech Republic
Confidentiality degree is not subject to a state or trade secret
RIV identification code RIV/00216224:14310/07:00023041
Organization unit Faculty of Science
ISSN 1335-8219
Keywords in English rep-PCR; staphylococci
Tags rep-PCR, staphylococci
Changed by Changed by: Mgr. Dana Nováková, Ph.D., učo 13197. Changed: 10/12/2007 14:49.
Abstract
Využití rep-PCR pro identifikaci klinicky významných druhů stafylokoků. Nováková, D. Česká sbírka mikroorganismů, Masarykova univerzita Úvod. Rychlá a spolehlivá identifikace klinických izolátů představujících pro pacienta život ohrožující nebezpečí je stále aktuálnější. Výskyt a závažnost nozokomiálních, ale i běžných infekcí způsobených stafylokoky patří mezi jeden z nejsledovanějších problému dnešní mikrobiologie. Metodika. Zástupci devíti nejčastěji izolovaných a zároveň klinicky nejvýznamnější druhů a poddruhů stafylokoků člověka (S. aureus subsp. aureus, S. hominis subsp. hominis, S. hominis subsp. novobiosepticus, S. haemolyticus, S. saprophyticus subsp. saprophyticus, S. epidermidis, S. lugdunensis, S. warneri a S. simulans) pocházejících z různých typů materiálu byly podrobeny analýze repetitivních sekvencí za použití amplifikace s primery (GTG)5. Výsledky. Sluková analýza prokázala, že všechny druhy zahrnuté do studie tvoří druhově specifické, dobře odlišitelné rep-(GTG)5 profily. Nejvíce homogenní profily byly zjištěny u kmenů Staphylococcus lugdunensis (téměř 89%) a dále u kmenů Staphylococcus epidermidis (asi 70%). Nejvíce heterogenní profily byly naopak prokázány u kmenů Staphylococcus aureus subsp. aureus (kolem 40%). Shluková analýza zahrnující zástupce všech validně popsaných stafylokoků, však ukázala, že i přes poměrně nízkou podobnost profilů těchto izolátů, jsou tyto jasně odlišitelné od profilů ostatních taxonů. Dvojice poddruhů S. hominis subsp. hominis, S. hominis subsp. novobiosepticus a S. saprophyticus subsp. saprophyticus a typový kmen S. saprophyticus subsp. bovis netvořily poddruhově specifické profily a náležely do společných shluků. Závěr. Studie jasně prokázala vhodnost rep-(GTG)5 PCR pro rychlou a spolehlivou druhovou identifikaci klinicky významných stafylokoků. Práce byla částečně podpořena projektem MSM0021622416.
Abstract (in English)
Application of rep-PCR for identification of staphylococci
Links
MSM0021622416, plan (intention)Name: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Diversity of Biotic Communities and Populations: Causal Analysis of variation in space and time
PrintDisplayed: 30/7/2024 05:00