2007
Využití rep-PCR v bakteriální taxonomii
ŠVEC, PavelZákladní údaje
Originální název
Využití rep-PCR v bakteriální taxonomii
Název anglicky
Application of rep-PCR in the bacterial taxonomy
Autoři
ŠVEC, Pavel (203 Česká republika, garant)
Vydání
Aktuality v mikrobiální diagnostice, 2007
Další údaje
Jazyk
čeština
Typ výsledku
Konferenční abstrakt
Obor
10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele
Česká republika
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Kód RIV
RIV/00216224:14310/07:00023296
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
Klíčová slova anglicky
rep-PCR; identification; taxonomy
Štítky
Změněno: 24. 3. 2010 13:13, doc. RNDr. Pavel Švec, Ph.D.
V originále
Metody rep-PCR (repetitive sequence-based PCR) jsou založeny na shlukové analýze PCR produktů získaných s primery komplementárními ke krátkým repetitivním sekvencím, které jsou rozšířeny v genomech prokaryot. V bakteriální taxonomii jsou nejčastěji využívány primery komplementární k sekvencím ERIC, REP, BOX a (GTG)5. Tyto metody našly uplatnění jak pro identifikaci, tak pro vnitrodruhovou typizaci širokého spektra grampozitivních i gramnegativních bakterií. Vzhledem k jednoduchosti provedení, dobré reprodukovatelnosti, časové nenáročnosti a nízké ceně jsou rep-PCR metody velmi vhodné nejen pro identifikaci jednotlivých kmenů, ale rovněž pro rychlou a spolehlivou diferenciaci početných skupin izolátů. Na pracovišti České sbírky mikroorganismů (PřF MU) byla doposud využita především (GTG)5-PCR pro identifikaci mléčných bakterií (např. enterokoky, laktobacily, laktokoky, streptokoky) a ERIC-PCR pro typizaci zástupců rodu Aeromonas. Podpořeno projektem MSM 0021622416.
Anglicky
This work deals wit application of repetitive sequence-based PCR for identification and characterization of bacteria.
Návaznosti
| MSM0021622416, záměr |
|