BARNAT, Jiří, Luboš BRIM, Ivana ČERNÁ, Sven DRAŽAN a David ŠAFRÁNEK. Parallel Model Checking Large-Scale Genetic Regulatory Networks with DiVinE. In Electronic Notes in Theoretical Computer Science. Vol. 194/3. Elsevier: Elsevier Science, 2008, s. 35-50, 15 s. ISSN 1571-0661.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Parallel Model Checking Large-Scale Genetic Regulatory Networks with DiVinE
Název česky Paralelní ověřování rozsáhlých genetických regulačních sítí nástrojem DiVinE
Autoři BARNAT, Jiří (203 Česká republika), Luboš BRIM (203 Česká republika), Ivana ČERNÁ (203 Česká republika), Sven DRAŽAN (203 Česká republika) a David ŠAFRÁNEK (203 Česká republika, garant).
Vydání Vol. 194/3. Elsevier, Electronic Notes in Theoretical Computer Science, od s. 35-50, 15 s. 2008.
Nakladatel Elsevier Science
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Stať ve sborníku
Obor 10201 Computer sciences, information science, bioinformatics
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Kód RIV RIV/00216224:14330/08:00024143
Organizační jednotka Fakulta informatiky
ISSN 1571-0661
Klíčová slova anglicky genetic regulatory networks; discrete simulation; parallel model checking
Štítky discrete simulation, genetic regulatory networks, parallel model checking
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnil: prof. RNDr. Luboš Brim, CSc., učo 197. Změněno: 18. 11. 2008 12:30.
Anotace
Studies of cells in silico can greatly reduce the need for expensive and prolonged laboratory experimentation. The use of model checking for the analysis of biological networks has attracted much attention recently. One of the practical limitations is the size of the model. In the paper we report on parallel model checking of genetic regulatory network using the model-checker DiVinE. The approach can check linear time properties on large networks.
Anotace česky
Studium buněk živých organismů prostřednictvím umělého modelu (in silico) se ukazuje jako metoda, která může značně usnadnit nákladný a obtížný laboratorní výzkum. Pro analýzu chování biochemických sítí je již několik let nasazována metoda ověřování modelů. Základním problémem při praktickém nasazení této metody je velikost stavového prostoru modelovaného systému molekulární dynamiky. V tomto článku je popsán paralelní přístup k simulaci a ověřování dynamických modelů biologických sítí.
Návaznosti
MSM0021622419, záměrNázev: Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy
1ET408050503, projekt VaVNázev: Techniky automatické verifikace a validace softwarových a hardwarových systémů
Investor: Akademie věd ČR, Techniky automatické verifikace a validace softwarových a hardwarových systémů
VytisknoutZobrazeno: 26. 4. 2024 13:59