p 2007

Automation of biomedical image acquisition and analysis in optical microscopy

KOZUBEK, Michal

Základní údaje

Originální název

Automation of biomedical image acquisition and analysis in optical microscopy

Název česky

Automatizace pořizování a zpracování biomedicínských obrazů v optické mikroskopii

Autoři

Vydání

Seminar of the Centre for Image Analysis, 2007

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Vyžádané přednášky

Obor

20200 2.2 Electrical engineering, Electronic engineering, Information engineering

Stát vydavatele

Švédsko

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Organizační jednotka

Fakulta informatiky

Klíčová slova anglicky

automated microscopy; image analysis

Příznaky

Mezinárodní význam
Změněno: 8. 1. 2009 19:47, prof. RNDr. Michal Kozubek, Ph.D.

Anotace

V originále

Biomedical image data can be produced by different instruments. For the exploration of cell structure and function, the most frequent instrument is optical microscope (typically cells or their components stained with fluorescent dyes are observed). The image formed in the microscope can be recorded using a special low-light camera, transferred to computer memory and analysed by computer. Although camera is a two-dimensional device, more dimensions can be acquired using scanning (e.g., third spatial dimension, spectral dimension, time dimension or viewing angle dimension). Due to the increasing complexity and volume, the resulting multidimensional data often need computer analysis with a high degree of automation. The talk will attend to the computer analysis of different types of biomedical image data generated by optical microscopy and related automation efforts. It will be accompanied by examples on fixed cells, on live cells as well as on cDNA-microarrays.

Česky

Přednáška se zabývala automatizací pořizování a zpracování biomedicínských obrazů v optické mikroskopii.

Návaznosti

LC535, projekt VaV
Název: Dynamika a organizace chromosomů během buněčného cyklu v normě a patologii
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Dynamika a organizace chromosomů během buněčného cyklu v normě a patologii
MSM0021622419, záměr
Název: Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy
2B06052, projekt VaV
Název: Vytipování markerů, screening a časná diagnostika nádorových onemocnění pomocí vysoce automatizovaného zpracování multidimenzionálních biomedicínských obrazů (Akronym: Biomarker)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Vytipování markerů, screening a časná diagnostika nádorových onemocnění pomocí vysoce automatizovaného zpracování multidimenzionálních biomedicínských obrazů