HOLOCHOVÁ, Pavla, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Roman PANTŮČEK a Jiří DOŠKAŘ. Genome analysis of staphylococcal exfoliative toxin A converting bacteriophages. In XII. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků. Brno: Masarykova univerzita, 2008, s. 33. ISBN 978-80-210-4526-2.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Genome analysis of staphylococcal exfoliative toxin A converting bacteriophages
Název česky Analýza genomu exfoliatin A konvertujících stafylokokových bakteriofágů
Autoři HOLOCHOVÁ, Pavla (203 Česká republika), Vladislava RŮŽIČKOVÁ (203 Česká republika, garant), Roman PANTŮČEK (203 Česká republika) a Jiří DOŠKAŘ (203 Česká republika).
Vydání Sborník příspěvků. Brno, XII. Setkání biochemiků a molekulárních biologů, s. 33-33, 2008.
Nakladatel Masarykova univerzita
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Stať ve sborníku
Obor Genetika a molekulární biologie
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Kód RIV RIV/00216224:14310/08:00025766
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
ISBN 978-80-210-4526-2
Klíčová slova anglicky Staphylococcus aureus; exfoliative toxin A; converting phage
Štítky converting phage, exfoliative toxin A, Staphylococcus aureus
Příznaky Mezinárodní význam
Změnil Změnil: prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D., učo 842. Změněno: 11. 6. 2010 09:27.
Anotace
Introduction: The exfoliative toxin A (ETA) is coded by the eta gene of S. aureus prophage. We isolated three eta-positive phages from the clinical S. aureus strains. ETA-negative strain SAU1039 was lysogenized by these phages and was converted into a producer of ETA. Our results indicate that ETA-converting B phages that morphologically resemble the phages of the family Siphoviridae seem to be the major mediators of the eta gene horizontal transfer among the S. aureus strains. We also found that the eta-positive A phage transposed the eta gene into recipient strain, but the lysogens were not able to produce the ETA. On the basis of genomic sequence analysis and alignments both the converting B phages were found to be equal but they differed from the eta-positive A phage in some characteristics. Methods: PCR detection of integrase types and DNA regions: integrase (int), terminase (ter), portal protein (por), holin (hol) amidase (ami), and exfoliative toxin A (eta) genes. Sequencing of target genes, genomic regions or two conservative segments (H3 and H4).Comparative genomics of A and B phages based on sequence studies. Comparison with known sequences of Staphylococcus phages accessible from bioinformatics sources. Results: We carried out the molecular analysis of three ETA-converting phages, i.e. serotype A like phi435 and two serotype B like phages designated phi531 and phi557. We focused our attention on the int, ter, por, hol, ami and eta genes, and two conservative segments H3 and H4 located on two HindIII restriction fragments. On the basis of analyses of target sequences we found out the high sequence similarity between the eta-positive B phages from our region and the Japanese phage phiETA (GenBank acc. no. AP001553). The A phage showed the gene sequence similarities with B phages but differed from them in two genomic regions, the por gene and H4 segment. Conclusions: We found the high sequence similarity in studied genome regions between our ETA-converting B phages and the reference ETA-converting phage phiETA (GenBank acc. no. AP001553) but they showed some genomic differences from the eta-positive A phage. The manner how the A phage has acquired the eta gene remains to be elucidated.
Anotace česky
neuvedeno
Návaznosti
MSM0021622415, záměrNázev: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
VytisknoutZobrazeno: 14. 7. 2024 14:20