TransMap Viewer

STREHOVSKÝ, Michal, Irena KRONTORÁD KOUTNÁ and Petr KRONTORÁD. TransMap Viewer. 2007.

Basic information

• Original name: TransMap Viewer
• Name in Czech: TransMap Viewer
• Authors: STREHOVSKÝ, Michal (703 Slovakia, guarantor, belonging to the institution), Irena KRONTORÁD KOUTNÁ (203 Czech Republic) and Petr KRONTORÁD (203 Czech Republic).
• Edition: 2007.

Other information

• Original language: English
• Type of outcome: Software
• Field of Study: 20200 2.2 Electrical engineering, Electronic engineering, Information engineering
• Country of publisher: Czech Republic
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• WWW: URL
• Organization unit: Faculty of Informatics
• Keywords in English: microarray; transcription density map
• Technical parameters: Vhodné pro OS Win32
• Tags: microarray, transcription density map
• Tags: International impact

Abstract

TransMap Viewer is a software tool specialized in the visualization of expression profile data using transcription maps. Transcription maps enable to reveal clusters of highly expressed genes in chromosomal domains. The application enables loading of data from one experiment as well as several experiments simultaneously. When loading multiple experiments, the software offers the feature of two-step visualization, which enables to display differences between expression values of genes in individual experiments.

Abstract (in Czech)

TransMap Viewer je softwarový nástroj specializovaný na vizualizaci expresních dat pomocí transkripčních map. Transkripční mapy umožňují odhalit shluky vysoce exprimovaných genů v chromozomálních oblastech. Do aplikace je možné načíst data z jediného experimentu nebo několika experimentů současně. Při načítání více experimentů software poskytuje funkci dvoukolové vizualizace, která umožňuje zobrazit rozdíly mezi expresními hodnotami genů v jednotlivých experimentech.

Links

• MSM0021622430, plan (intention): Name: Funkční a molekulární charakteristiky nádorových a normálních kmenových buněk - identifikace cílů pro nová terapeutika a terapeutické strategie

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Functional and molecular characteristics of cancer and normal stem cells - identification of targets for novel therapeutics and therapeutic strategies

• 2B06052, research and development project: Name: Vytipování markerů, screening a časná diagnostika nádorových onemocnění pomocí vysoce automatizovaného zpracování multidimenzionálních biomedicínských obrazů (Acronym: Biomarker)

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Determination of markers, screening and early diagnostics of cancer diseases using highly automated processing of multidimensional biomedical images